Colimovirus
Los colimovirus [2] ( del lat. Caulimoviridae ) son una familia de virus de plantas que contienen ADN con un mecanismo de transcripción inversa y ADN de doble cadena , es decir, virus que contienen una etapa de transcripción inversa en su ciclo de replicación.
Estructura de los viriones
El virión es simple, sin envoltura lipídica. La morfología de la nucleocápside está representada por 2 formas principales: en forma de bastón e icosaédrica. La forma de la nucleocápside depende del tamaño del virus. Los viriones en forma de bastón tienen aproximadamente 35 a 50 nm de diámetro y pueden tener hasta 900 nm de longitud. La cápside icosaédrica tiene un diámetro de 45 a 50 nm y aproximadamente la misma longitud.
Estructura y replicación del genoma
El genoma de este virus es un ADN bicatenario lineal o cíclico no segmentado . El tamaño del genoma es de aproximadamente 6-8 kbs. Dependiendo del virus, el genoma puede tener un marco de lectura abierto (ORF), como en Petuvirus , o más de ocho, como en Soymovirus . El genoma de esta familia viral codifica las siguientes proteínas: transcriptasa inversa , proteasa , proteínas estructurales, así como otras proteínas con funciones desconocidas, pero de una forma u otra necesarias para la replicación del virus .
La replicación ocurre tanto en el citoplasma como en el núcleo de la célula huésped. Primero, el genoma viral ingresa al citoplasma. Allí forma un minicromosoma superenrollado. Transcribe el ARNm del virus, lo cual es redundante (porque se expresa dos veces en algunas partes del genoma). Este ARN transcrito ingresa al citoplasma, donde desempeña dos funciones. Se puede utilizar como plantilla para la traducción de proteínas virales o se puede transcribir de forma inversa a dsDNA utilizando la reversa viral . Dado que estos virus tienen mucho en común con los retrovirus , a menudo se agrupan como pararetrovirus. Sin embargo, aquí existe una diferencia importante entre los retrovirus y los virus de la familia Caulimoviridae . A diferencia de los retrovirus, no integran su genoma en los cromosomas , ya que su genoma no codifica la enzima integrasa .
Sin embargo, hay especies de la familia de los Colimovirus, como el virus de limpieza de venas de Petunia , que ocasionalmente (principalmente en condiciones de estrés) pueden integrar su genoma en el genoma económico [3] . Por lo general, estos provirus se denominan pararetrovirus endógenos (EPRV).
Clasificación
Según el Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) , a partir de marzo de 2016, la familia incluye 8 géneros [4] :
- Género Badnavirus (40 especies)
- Especie tipo del virus del moteado amarillo de Commelina
- Género Caulimovirus (11 especies)
- Especie tipo Virus del mosaico de la coliflor
- Género Cavemovirus (2 especies)
- Especie tipo Virus del mosaico de las venas de la yuca
- Género Petuvirus (1 especie)
- Especie Virus del aclaramiento de venas de Petunia
- Género Rosadnavirus (1 especie)
- Especies del virus de la vena amarilla rosa
- Género Solendovirus (2 especies)
- Especie tipo Virus del aclaramiento de las venas del tabaco
- Género Soymovirus (4 especies)
- Especie tipo Virus del moteado clorótico de la soja
- Género Tungrovirus (1 especie)
- Especies Virus baciliforme del tungro del arroz
La especie del virus de la vena amarilla de la rosa tiene una organización genómica inusual que la convierte en una especie única [5] .
Notas
- ↑ Taxonomy of Viruses en el sitio web del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) .
- ↑ Pinevich A. V. , Sirotkin A. K. , Gavrilova O. V. , Potekhin A. A. Virología: libro de texto. - San Petersburgo. : St. Petersburg University Press, 2012. - P. 275. - ISBN 978-5-288-05328-3 .
- ↑ Harper G., Hull R., Lockhart B. y Olszewski N. (2002). Secuencias virales integradas en genomas vegetales. Revisión anual de fitopatología 40 : 119-136. doi : 10.1146/annurev.phyto.40.120301.105642 . PMID 12147756 .
- ↑ Taxonomy of Viruses en el sitio web del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . (Consultado: 26 de marzo de 2017) .
- ↑ Mollov D., Lockhart B., Zlesak DC, Olszewski N. (2012). Secuencia de nucleótidos completa del virus de la vena rosa amarilla, un miembro de la familia Caulimoviridae que tiene una nueva organización genómica. Arco Virol .
Enlaces
Clasificación de virus según Baltimore |
---|
ADN | I: virus |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
varidnaviria | Bamfordvirae_ | Nucleocitoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota_ | |
---|
|
---|
Helvetiavirae_ | divididoviricota_ | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae_
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Desclasificado | naldaviricetes | lefavirales |
|
---|
Desclasificado |
|
---|
|
---|
Desclasificado |
- familia : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae_
- clavaviridae_
- Fuselloviridae_
- Globuloviridae_
- Guttaviridae_
- Halspiviridae_
- Ovalivridae
- Plasmaviridae_
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae_
- Thaspiviridae_
- Géneros : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: ADN virus |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota_ | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae_ | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota_ | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae_
|
---|
recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae_ | |
---|
|
---|
Desclasificado |
|
---|
|
|
|
---|
ARN | | IV: (+) virus ARN |
---|
riboviria | Orthornavirae | kitrinoviricota_ | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alfatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae_
|
---|
Martellivirales |
|
---|
timovirales |
- Alfaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae_
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae_
- Luteoviridae_
- Tombusviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
lenarviricota_ | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae_
- Fiersviridae_
- Solspiviridae_
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae_
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae_
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae_
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae_
- Flaviridae_
- Secoviridae_
- Dicistroviridae
- Policipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae_
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Desclasificado |
- Familias : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
DE | |
---|