El clima de Malasia es ecuatorial , monzónico , las amplitudes térmicas diarias y anuales son pequeñas. Las temperaturas medias anuales oscilan entre 25 y 28 °C; en las zonas bajas, tramos bajos de los ríos, la temperatura puede subir hasta los 36 °C. En las montañas , el clima es más fresco, a gran altura, templado, fresco.
Las precipitaciones caen uniformemente a lo largo del año , pero se caracterizan por estaciones más secas y más húmedas asociadas con los monzones . Durante el verano, los monzones del Océano Índico son fuertes y persistentes, lo que da como resultado una temporada de verano húmeda en la Península Malaya . En Borneo , especialmente en el norte, se observan monzones del Océano Pacífico en invierno y hay una estación invernal húmeda.
En las áreas costeras y de tierras bajas, caen 1500-2500 mm de precipitación anualmente, en el norte de Borneo la precipitación cae más que en la Península Malaya. En el interior, zonas montañosas, caen 5000 mm de precipitación, en algunos lugares hasta 6500. Los días de lluvia se notan 200 o más.
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