La bandera de Ærø es la bandera no oficial de la isla de Ærø . Hay tres colores en la bandera: amarillo, verde y rojo.
Los colores rojo y amarillo simbolizan el estandarte del duque Cristián, primo de Cristián IV . El verde simboliza la isla verde de Ærø . La bandera supuestamente fue creada entre 1622 y 1633 por el príncipe Christian.