La orientación es la orientación de una estructura monocatenaria en una molécula de ácido nucleico [ 1] .
El nombre de los átomos de carbono en los nucleótidos (basado en la numeración de los átomos de carbono en la molécula de azúcar pentosa) da lugar a dos extremos: 5' y 3' (pronunciados como cinco tiempos y tres tiempos , en inglés five prime end, three prime fin ).
Las posiciones relativas de los análogos estructurales de las cadenas de ácidos nucleicos, los genes , los factores de transcripción , las polimerasas , generalmente se nombran de acuerdo con la posición hacia o desde los extremos 5' y 3', respectivamente. La síntesis de ácidos nucleicos es posible in vivo solo en la dirección de 5' a 3', ya que las polimerasas de ADN y ARN unen nuevos residuos de nucleótidos solo al grupo 3' - hidroxilo (-OH) usando un enlace fosfodiéster . Normalmente, el registro de secuencias de nucleótidos de ADN y ARN se lleva a cabo en la dirección de 5' a 3' [2] .