Genómica estructural
La genómica estructural busca describir la estructura tridimensional de cada proteína codificada por un genoma dado. Se utiliza una combinación de enfoques experimentales y de modelado. La diferencia fundamental entre la genómica estructural y la predicción estructural tradicional es que la genómica estructural intenta determinar la estructura de cada proteína codificada por el genoma, en lugar de centrarse en una proteína en particular. Con las secuencias genómicas completas disponibles, la predicción de la estructura se puede hacer más rápidamente mediante una combinación de enfoques experimentales y de modelado, especialmente porque la disponibilidad de una gran cantidad de genomas ordenados y estructuras de proteínas previamente resueltas permite a los científicos construir sobre las estructuras de homólogos previamente resueltos.
Dado que la estructura de una proteína está estrechamente relacionada con la función de una proteína, la genómica estructural permite conocer las funciones de una proteína. Además de dilucidar las funciones de las proteínas, la genómica estructural se puede utilizar para identificar nuevos pliegues de proteínas y objetivos potenciales para el descubrimiento de fármacos.
Métodos
La genómica estructural utiliza secuencias genómicas completas de varias maneras para determinar las estructuras de las proteínas. La secuencia del gen de la proteína diana se puede comparar con una secuencia conocida y, a continuación, se puede inferir información estructural a partir de la estructura de la proteína conocida. La genómica estructural puede utilizar un enfoque basado en modelos que se basa en una coincidencia entre una proteína desconocida y una estructura de proteína resuelta.
Véase también
Literatura
- Chandonia JM, Brenner SE El impacto de la genómica estructural: expectativas y resultados // Ciencia : revista. - 2006. - enero ( vol. 311 , no. 5759 ). - Pág. 347-351 . -doi : 10.1126 / ciencia.1121018 . — PMID 16424331 .
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