Las endonucleasas son proteínas del grupo de las nucleasas que escinden los enlaces fosfodiéster en el medio de la cadena de polinucleótidos . Las endonucleasas de restricción , o endonucleasas de restricción , escinden el ADN en lugares específicos (llamados sitios de restricción), se clasifican en tres tipos (I, II y III) según su mecanismo de acción. Estas proteínas se utilizan a menudo en ingeniería genética para crear ADN recombinante, que luego se introduce en células bacterianas, vegetales o animales.
Como resultado de la degradación enzimática de las endonucleasas, se produce la disolución completa de la cromatina en los núcleos cariolíticos.
La nicasa ( endonucleasa de muescas ) es una enzima que corta solo una cadena de ADN de doble cadena en ciertas secuencias de nucleótidos (sitios de reconocimiento) llamados sitios de restricción . El resultado es una muesca en lugar de cortar el ADN. Las nicasas, junto con la ADN polimerasa 1 , se usan para reemplazar algunos de los nucleótidos en la secuencia de ADN con sus análogos marcados con un marcador fluorescente o radiactivo , lo que luego permite que este ADN se use como sonda para hibridación fluorescente in situ , transferencia , y una serie de otros métodos de biología molecular.