IRF1

Factor regulador de interferón 1

Representación de PDB basada en 1if1.
Estructuras Disponibles
AP Búsqueda de ortólogos: PDBe , RCSB
Identificadores
SímboloIRF1  ; IRF-1; MAR
Identificaciones externasOMIM:  147575 MGI :  96590 HomoloGene :  1658 GeneCards : Gen IRF1
perfil de expresión de ARN
Más información
ortólogos
VistaHumanoRatón
Entrez365916362
ConjuntoENSG00000125347ENSMUSG00000018899
UniProtP10914P15314
RefSeq (ARNm)NM_002198NM_001159393
RefSeq (proteína)NP_002189NP_001152865
Lugar geométrico (UCSC)Canal 5:
131,82 – 131,83 Mb
Chr 11:
53.77 – 53.78 Mb
Buscar en PubMed[una][2]

El factor regulador interferón 1 es una proteína que en humanos está codificada por el gen IRF1 . [1] [2]

Función

El factor regulador Interferón 1 fue el primer miembro de la familia del factor de transcripción regulador (IRF) del interferón en ser identificado. Primero se describió como un factor de transcripción capaz de activar la expresión de las citoquinas del interferón beta , [3] pero posteriormente se descubrió que el IRF-1 puede funcionar como un activador o represor de la transcripción de varios genes diana. IRF-1 regula la expresión de genes diana al unirse a elementos de respuesta estimuladora de interferón (ISRE) en sus promotores . La proteína IRF-1 se une a ISRE a través de dominios de unión a ADN de hélice-vuelta-hélice N-terminal, [4] que están altamente conservados entre todas las proteínas IRF.

Además de su función como factor de transcripción, también se ha demostrado que IRF-1 es capaz de transactivar la proteína supresora de tumores p53 a través de su cofactor p300 . [5]

Se ha demostrado que IRF-1 desempeña un papel en las respuestas inmunitarias que regulan la apoptosis , el daño del ADN y la supresión de tumores . [6]

Reglamento

Se encontró que el extremo C-terminal de IRF-1 regula la capacidad de activar la transcripción, los nanocuerpos dirigidos a esta región (MF1) son capaces de aumentar la actividad de IRF-1. [7]

Organismos modelo

Fenotipo de ratón knockout Irf1

Se utilizaron organismos modelo para estudiar las funciones de IRF1. Se creó una cepa de ratón knockout provisional , llamada Irf1 tm1a(EUCOMM)Wtsi , [11] [12] en el marco del programa internacional del Consorcio de ratones Knockout , un gran proyecto de mutagénesis para crear y distribuir animales modelo para la investigación de enfermedades por interesados científicos - en el Instituto Sanger . [13] [14] [15]

Los animales machos y hembras se sometieron a pruebas fenotípicas estándar para determinar el efecto de la eliminación. [9] [16] Se realizaron veinticinco ensayos y se encontró que dos parámetros fenotípicos eran anormales. Los animales homocigóticos mutantes mostraron patología de los linfocitos de sangre periférica , en particular, una disminución en el número de células T CD8 positivas y células NK y un aumento en las células T CD4 positivas. Los ratones también tenían fenotipos anormales de la piel determinados por el examen de la epidermis caudal . [9]

Interacciones

Se ha demostrado que IRF1 interactúa con:

Véase también

Notas

  1. Maruyama M., Fujita T., Taniguchi T. Secuencia de una codificación de cDNA para IRF-1 humano  //  Nucleic Acids Res : diario. - 1989. - junio ( vol. 17 , no. 8 ). — Pág. 3292 . doi : 10.1093 / nar/17.8.3292 . —PMID 2726461 .
  2. Itoh S., Harada H., Nakamura Y., White R., Taniguchi T. Asignación del gen del factor regulador de interferón humano-1 (IRF1) al cromosoma 5q23-q31  //  Genomics :  revista. - Academic Press , 1991. - Noviembre ( vol. 10 , no. 4 ). - P. 1097-1099 . -doi : 10.1016 / 0888-7543(91)90208-V . —PMID 1680796 .
  3. Miyamoto M., Fujita T., Kimura Y., Maruyama M., Harada H., Sudo Y., Miyata T., Taniguchi T. Expresión regulada de un gen que codifica un factor nuclear, IRF-1, que se une específicamente a Elementos reguladores del gen IFN-beta  (inglés)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1988. - Septiembre ( vol. 54 , núm. 6 ). - Pág. 903-913 . - doi : 10.1016/S0092-8674(88)91307-4 . — PMID 3409321 .
  4. Escalante CR, Yie J., Thanos D., Aggarwal AK La estructura de IRF-1 con ADN unido revela determinantes de la regulación del interferón  //  Nature: revista. - 1998. - enero ( vol. 391 , no. 6662 ). - P. 103-106 . -doi : 10.1038/ 34224 . — PMID 9422515 .
  5. Dornan D., Eckert M., Wallace M., Shimizu H., Ramsay E., Hupp TR, Ball KL La unión del factor 1 regulador de interferón a p300 estimula la acetilación de p53 dependiente del ADN   // Mol . célula. Biol. : diario. - 2004. - noviembre ( vol. 24 , no. 22 ). - Pág. 10083-10098 . -doi : 10.1128/ MCB.24.22.10083-10098.2004 . —PMID 15509808 .
  6. Entrez Gene: factor regulador de interferón IRF1 1 . Archivado desde el original el 8 de marzo de 2010.
  7. Möller A., ​​​​Pion E., Narayan V., Ball KL Activación intracelular del factor regulador de interferón-1 por nanocuerpos en el dominio multifuncional (Mf1)  //  J. Biol. química  : diario. - 2010. - diciembre ( vol. 285 , no. 49 ). - Pág. 38348-38361 . -doi : 10.1074/ jbc.M110.149476 . — PMID 20817723 .
  8. ↑ Datos de infección de Citrobacter para Irf1 . Bienvenida Trust Sanger Institute. Consultado el 19 de marzo de 2015. Archivado desde el original el 3 de abril de 2015.
  9. 1 2 3 Gerdin AK Programa de genética de ratones Sanger: Caracterización de alto rendimiento de ratones knockout  //  Acta Ophthalmologica : diario. - Wiley-Liss , 2010. - Vol. 88 , núm. S248 . -doi : 10.1111/ j.1755-3768.2010.4142.x .
  10. Mouse Resources Portal Archivado el 24 de diciembre de 2011 en Wayback Machine , Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. International Knockout Mouse Consortium (enlace no disponible) . Consultado el 19 de marzo de 2015. Archivado desde el original el 20 de marzo de 2012. 
  12. Informática del genoma del ratón . Fecha de acceso: 19 de marzo de 2015. Archivado desde el original el 9 de enero de 2015.
  13. Skarnes WC, Rosen B., West AP, Koutsourakis M., Bushell W., Iyer V., Mujica AO, Thomas M., Harrow J., Cox T., Jackson D., Severin J., Biggs P., Fu J., Nefedov M., de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A. Un recurso de eliminación condicional para el estudio de la función del gen del ratón en todo el genoma  //  Nature: journal. - 2011. - vol. 474 , núm. 7351 . - P. 337-342 . -doi : 10.1038/ naturaleza10163 . — PMID 21677750 .
  14. ↑ La biblioteca de Dolgin E. Mouse será eliminada   // Nature . - 2011. - junio ( vol. 474 , no. 7351 ). - pág. 262-263 . -doi : 10.1038/ 474262a . —PMID 21677718 .
  15. Collins FS, Rossant J., Wurst W. Un ratón por todas las razones   // Cell . - Cell Press , 2007. - Enero ( vol. 128 , no. 1 ). - Pág. 9-13 . -doi : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . — PMID 17218247 .
  16. van der Weyden L., White JK, Adams DJ, Logan DW El conjunto de herramientas de la genética del ratón: revelando la función y el mecanismo. (Inglés)  // Genoma Biol : diario. - 2011. - vol. 12 , núm. 6 _ — Pág. 224 . -doi : 10.1186 / gb-2011-12-6-224 . —PMID 21722353 .
  17. Narayan V., Pion E., Landré V., Müller P., Ball KL Ubiquitinación dependiente del acoplamiento de la proteína supresora de tumores del factor regulador de interferón-1 por la ubiquitina ligasa CHIP  // J Biol Chem  .  : diario. - 2010. - Octubre ( vol. 286 , n. 1 ). - Pág. 607-619 . -doi : 10.1074/ jbc.M110.153122 . —PMID 20947504 .
  18. Kular RK, Yehiely F., Kotlo KU, Cilensek ZM, Bedi R., Deiss LP GAGE, una proteína antiapoptótica se une y modula la expresión de nucleofosmina/B23 y factor regulador de interferón 1  //  J. Interferon Cytokine Res. : diario. - 2009. - Octubre ( vol. 29 , no. 10 ). - Pág. 645-655 . -doi : 10.1089/ jir.2008.0099 . —PMID 19642896 .
  19. Narayan V., Eckert M., Zylicz A., Zylicz M., Ball KL Regulación cooperativa de la proteína supresora de tumores del factor regulador de interferón-1 por componentes centrales de la maquinaria de chaperonas moleculares  // J Biol Chem  .  : diario. - 2009. - Septiembre ( vol. 284 , n. 38 ). - P. 25889-25899 . -doi : 10.1074 / jbc.M109.019505 . —PMID 19502235 .
  20. Schaper F., Kirchhoff S., Posern G., Köster M., Oumard A., Sharf R., Levi BZ, Hauser H. Dominios funcionales del factor regulador de interferón I (IRF-1  )  // Biochem. j : diario. - 1998. - Octubre ( vol. 335 , no. 1 ). - P. 147-157 . — PMID 9742224 .
  21. Sharf R., Azriel A., Lejbkowicz F., Winograd SS, Ehrlich R., Levi BZ Análisis de dominio funcional de la proteína vinculante de secuencia de consenso de interferón (ICSBP) y su asociación con factores reguladores de interferón  //  J. Biol. química  : diario. - 1995. - junio ( vol. 270 , n. 22 ). - Pág. 13063-13069 . doi : 10.1074/ jbc.270.22.13063 . — PMID 7768900 .
  22. Umegaki N., Tamai K., Nakano H., Moritsugu R., Yamazaki T., Hanada K., Katayama I., Kaneda Y. Regulación diferencial de la expresión de carioferina alfa 2 por TGF-beta1 e IFN-gamma en humanos normales queratinocitos epidérmicos: contribución evidente de KPNA2 para la translocación nuclear de IRF-1  //  J. Invest. Dermatol. : diario. - 2007. - junio ( vol. 127 , n. 6 ). - P. 1456-1464 . -doi : 10.1038/ sj.jid.5700716 . —PMID 17255955 .
  23. Negishi H., Fujita Y., Yanai H., Sakaguchi S., Ouyang X., Shinohara M., Takayanagi H., Ohba Y., Taniguchi T., Honda K. Evidencia para la autorización de IFN inducido por IFN-gamma factor regulador 1 factor de transcripción por MyD88 en el programa de inducción de genes dependientes del receptor tipo Toll  (inglés)  // Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América  : revista. - 2006. - Octubre ( vol. 103 , no. 41 ). - Pág. 15136-15141 . -doi : 10.1073/ pnas.0607181103 . —PMID 17018642 .
  24. Masumi A., Wang IM, Lefebvre B., Yang XJ, Nakatani Y., Ozato K. La histona acetilasa PCAF es un coactivador inducible por éster de forbol de la familia IRF que confiere una mayor  capacidad de respuesta al interferón  Mol// célula. Biol. : diario. - 1999. - Marzo ( vol. 19 , no. 3 ). - Pág. 1810-1820 . —PMID 10022868 .
  25. Chatterjee-Kishore M., van Den Akker F., Stark GR El adenovirus E1A regula a la baja la transcripción de LMP2 al interferir con la unión de stat1 a IRF1  //  J. Biol. química  : diario. - 2000. - julio ( vol. 275 , no. 27 ). - Pág. 20406-20411 . -doi : 10.1074/ jbc.M001861200 . —PMID 10764778 .
  26. Sgarbanti M., Borsetti A., Moscufo N., Bellocchi MC, Ridolfi B., Nappi F., Marsili G., Marziali G., Coccia EM, Ensoli B., Battistini A. Modulation of human immunodeficiency virus 1 replication by factores reguladores del interferón  (inglés)  // Journal of Experimental Medicine : diario. — Prensa de la Universidad Rockefeller, 2002. — mayo ( vol. 195 , n.° 10 ). - P. 1359-1370 . -doi : 10.1084 / jem.20010753 . —PMID 12021315 .
  27. Lee JH, Chun T., Park SY, Rho SB El factor regulador de interferón 1 (IRF-1) regula la angiogénesis inducida por VEGF en HUVEC   // Biochim . Biografía. acta : diario. - 2008. - Septiembre ( vol. 1783 , n. 9 ). - Pág. 1654-1662 . -doi : 10.1016/ j.bbamcr.2008.04.006 . —PMID 18472010 .

Literatura