INTELIGENTE (base de datos)

SMART (Simple Modular Architecture Research Tool) es una base de datos utilizada en la identificación y análisis de dominios de proteínas en secuencias de proteínas [1] [2] . SMART utiliza un algoritmo basado en la aplicación de modelos ocultos de Markov a múltiples alineaciones para detectar dominios en secuencias de proteínas . En enero de 2012, SMART contenía 1009 modelos de dominio [3] . Los datos SMART se usaron para crear la Base de datos de dominios conservados ( CDD , Base de datos de dominios conservados) y también se presenta como parte de la base de datos InterPro . [cuatro]

La base de datos está organizada por el Laboratorio Europeo de Biología Molecular en Heidelberg .

Véase también

• PROSITO
• Interpro

Enlaces

• Sitio web INTELIGENTE

Notas

1. ↑ Schultz J., Milpetz F., Bork P., Ponting CP SMART, una herramienta de investigación de arquitectura modular simple: identificación de dominios de señalización   // Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América  : revista. - 1998. - mayo ( vol. 95 , n. 11 ). - Pág. 5857-5864 . -doi : 10.1073 / pnas.95.11.5857 . —PMID 9600884 .
2. ↑ Letunic I., Doerks T., Bork P. SMART 6: actualizaciones recientes y nuevos desarrollos  // Nucleic Acids Res  . : diario. - 2009. - Enero ( vol. 37 , núm. Número de base de datos ). - P.D229-32 . doi : 10.1093 / nar/gkn808 . —PMID 18978020 .
3. ↑ Letunic I., Doerks T., Bork P. SMART 7: actualizaciones recientes del recurso de anotación del dominio de proteínas  // Nucleic Acids Res  . : diario. - 2012. - Enero ( vol. 40 , núm. Número de base de datos ). - P.D302-5 . doi : 10.1093 / nar/gkr931 . —PMID 22053084 .
4. ↑ Mulder NJ, Apweiler R., Attwood TK, et al. InterPro: un recurso de documentación integrado para familias de proteínas, dominios y sitios funcionales   // Breve . Bioinformática: revista. - 2002. - Septiembre ( vol. 3 , no. 3 ). - pág. 225-235 . -doi : 10.1093 / bib/3.3.225 . — PMID 12230031 .