La secuencia de referencia de Cambridge ( CRS) para el ADN mitocondrial humano se investigó por primera vez en 1981. [2]
Un grupo de científicos dirigido por Frederick Senger de la Universidad de Cambridge secuenció el genoma mitocondrial de una mujer europea [3] en la década de 1970 y determinó que su longitud era de 16 569 pares de bases (0,0006 % del genoma nuclear humano), que contenía unos 37 genes . Esta secuencia se publicó por primera vez en 1981. [2]
Cuando otros investigadores repitieron la secuenciación, se notaron algunas inconsistencias sorprendentes. La secuencia publicada originalmente contenía once errores, incluido un par de bases adicional en la posición 3107 y asignaciones incorrectas de pares de bases individuales. Algunos de estos fueron el resultado de la contaminación con células bovinas y HeLa . Un CRS revisado y revisado ha sido publicado por Andrews et al. en 1999 [4] (Se ha conservado la numeración original de nucleótidos para evitar confusiones). La secuencia de referencia pertenece al haplogrupo europeo H2a2a1 . El CRS revisado se conoce como rCRS . Esta secuencia está depositada en la base de datos GenBank NCBI con el número de acceso NC_012920. [una]
Cuando la secuenciación del ADN mitocondrial se usa con fines genealógicos , los resultados a menudo se informan como diferentes del CRS revisado. El CRS es una secuencia de referencia, no un registro del ADNmt humano más antiguo. Las diferencias entre las muestras de prueba y CRS podrían surgir ya sea en el origen de CRS o en el origen de las muestras analizadas.
A veces también se ha utilizado una secuencia de referencia africana (yoruba) alternativa en lugar de la de Cambridge. Tiene un sistema de numeración diferente con una longitud de 16.571 pares de bases y representa el genoma mitocondrial de un individuo africano. Otras secuencias de referencia alternativas que también se han usado ocasionalmente incluyen secuencias africanas (Uganda), suecas y japonesas. [5]
En 2012, se propuso reemplazar la Secuencia de referencia de Cambridge revisada (rCRS) con la nueva Secuencia de referencia reconstruida de Sapiens (RSRS). [6] RSRS conserva el mismo sistema de numeración que CRS, pero representa el genoma ancestral de Mitochondrial Eve , a partir del cual se originaron todas las mitocondrias humanas actualmente conocidas. RSRS debería ser más útil para comparar cambios en diferentes haplogrupos [3] , pero esta afirmación es discutible. [7] FamilyTreeDNA informa los resultados de un estudio de mtDNA tanto para rCRS como para RSRS. [3]