Afinidad (bioquímica)

En bioquímica , la afinidad (también afinidad de unión ) es una medida de la tendencia de las moléculas a unirse a otras moléculas, por ejemplo, entre compañeros de unión en una interacción proteína - ligando : cuanto mayor es la afinidad, mayor es la constante de asociación Ka ( también llamada la constante de enlace).

Características

Sin embargo, en la actualidad, en lugar de la constante de asociación, se suele utilizar la medida inversa, la constante de disociación K d : cuanto mayor es la afinidad de la proteína por su ligando, menor es la constante de disociación del complejo. Sobre el ejemplo de la formación/escisión del complejo enzima-sustrato [ES].

definiciones de acuerdo con la ley de acción de masas o constantes cinéticas (constantes de velocidad k) se enumeran aquí:

constante de asociación (constante de enlace)	$K_{a}={[ES] \over [E]\cdot [S]}$	$K_{a}={k_{1} \sobre k'_{1))$
Constante de disociación	$K_{d}={[E]\cdot [S] \over [ES]}$	$K_{d}={k'_{1} \sobre k_{1))$ .

En cinética enzimática , la Km , la constante de Michaelis , se utiliza a veces como una medida de la afinidad de una enzima por su sustrato. En la práctica, esto tiene cierto derecho, pero teóricamente, la constante de disociación del complejo ES K d y la constante de Michaelis deben distinguirse estrictamente. Según Briggs y Haldane, la constante de Michaelis también depende del número de cambios k 2 y se calcula de la siguiente manera:

K_{m}={k'_{1}+k_{2} \sobre k_{1))

La derivación de K m a K d sólo es posible si . Esta suposición no es adecuada en todos los casos, pero Leonor Michaelis y Maud Menten la hicieron originalmente para derivar la ecuación de Michaelis-Menten . ${\displaystyle k_{2}\ll k'_{1))$

La afinidad se puede determinar utilizando un ensayo de unión de ligandos .

Véase también

Literatura

Jeremy M. Berg, John L. Timochko, Lubert Strayer: Bioquímica. Sexta edición, Spectrum Academic Publishing, Heidelberg, 2007. ISBN 978-3-8274-1800-5 .
Donald Voet, Judith G. Voet: Bioquímica. 3. Edición, John Wiley & Sons, Nueva York, 2004. ISBN 0-471-19350-X .
Bruce Alberts , Alexander Johnson, Peter Walter, Julian Lewis, Martin Ruff, Keith Roberts: La biología molecular de la célula , 5. Edición, Taylor y Francis, 2007, ISBN 978-0-8153-4106-2 .