Cromodominio

cromodominio

La proteína de cromodominio polycomb [1] .
Identificadores
Símbolo cromodominio
Pfam PF00385
Interpro IPR000953
INTELIGENTE SM00298
PROSITO PS50013
SCOP 1pfb
SUPERFAMILIA 1pfb
DDC cd00024
Estructuras proteicas disponibles
Pfam estructuras
AP RCSB AP ; PDBe ; PDBj
PDBsum modelo 3d

Un  cromodominio ( modificador de la organización de la cromatina [ 2] ) es un dominio proteico de unos 40-50 residuos de aminoácidos de largo , que generalmente se encuentra en proteínas asociadas con la remodelación de la cromatina . El dominio está altamente conservado entre plantas y animales y está presente en muchas proteínas diferentes del genoma . Algunos genes que contienen cromodominios tienen isoformas formadas por corte y empalme alternativo y no contienen cromodominios [3] . En los mamíferos, las proteínas que contienen cromodominios están involucradas en los procesos de regulación génica asociados con la remodelación de la cromatina y la formación de regiones de heterocromatina [4] . Las proteínas que contienen cromodominio también se unen a histonas metiladas [5] [6] y están presentes en el complejo de silenciamiento génico inducido por ARN [7] .

Véase también

Notas

  1. Min J., Zhang Y., Xu RM Base estructural para la unión específica del cromodominio Polycomb a la histona H3 metilada en Lys 27  // Genes Dev  .  : diario. - 2003. - Agosto ( vol. 17 , no. 15 ). - Pág. 1823-1828 . -doi : 10.1101/ gad.269603 . —PMID 12897052 .
  2. Messmer S., Franke A., Paro R. Análisis del papel funcional del dominio cromo de Polycomb en Drosophila melanogaster  // Genes Dev  .  : diario. - 1992. - julio ( vol. 6 , no. 7 ). - P. 1241-1254 . -doi : 10.1101/ gad.6.7.1241 . —PMID 1628830 .
  3. Tajul-Arifin K., Teasdale R., Ravasi T., Hume DA, Mattick JS Identificación y análisis de proteínas que contienen cromodominio codificadas en el transcriptoma de ratón   // Genome Res : diario. - 2003. - vol. 13 , núm. 6b . - pág. 1416-1429 . - doi : 10.1101/gr.1015703 . — PMID 12819141 .
  4. Jones DO, Cowell IG, Singh PB Proteínas de cromodominio de mamíferos: su papel en la organización y  expresión del genoma  // BioEssays : diario. - 2000. - vol. 22 , núm. 2 . - pág. 124-137 . - doi : 10.1002/(SICI)1521-1878(200002)22:2<124::AID-BIES4>3.0.CO;2-E . —PMID 10655032 .
  5. Nielsen PR, Nietlispach D., Mott HR, Callaghan J., Bannister A., ​​​​Kouzarides T., Murzin AG, Murzina NV, Laue ED Estructura del cromodominio HP1 unido a la histona H3 metilada en lisina   9 // - 2002. - vol. 416 , núm. 6876 . - P. 103-107 . -doi : 10.1038/ nature722 . —PMID 11882902 .
  6. Jacobs SA, Khorasanizadeh S. Estructura del cromodominio HP1 unido a una cola H3 de histona metilada en 9 lisina  //  Science: revista. - 2002. - vol. 295 , núm. 5562 . - Pág. 2080-2083 . -doi : 10.1126 / ciencia.1069473 . — PMID 11859155 .
  7. Verdel A., Jia S., Gerber S., Sugiyama T., Gygi S., Grewal SI, Moazed D. Orientación de la heterocromatina mediada por ARNi por el complejo RITS  //  Ciencia: revista. - 2004. - vol. 303 , núm. 5658 . - Pág. 672-676 . -doi : 10.1126 / ciencia.1093686 . — PMID 14704433 .