BioRxiv

bioRxiv
URL biorxiv.org
Comercial No
tipo de sitio La ciencia
Idiomas) inglés
Dueño Laboratorio en Cold Spring Harbor
Autor Richard North, John Inglis
Comienzo del trabajo noviembre de 2013  ( 2013-11 )
País

bioRxiv (pronunciado "bio(a)rhiv") es un archivo electrónico gratuito de artículos científicos y preprints sobre biología, creado en 2013 por los miembros del personal del Laboratorio Cold Spring Harbor, Richard Sever y John Inglis, similar al ya popular arXiv.org .

Los autores publican artículos no revisados ​​previamente en bioRxiv para recibir comentarios de otros miembros del portal o para afirmar la primacía del descubrimiento. Los manuscritos no se revisan antes de la publicación, pero los moderadores los revisan inicialmente para detectar plagio. Alrededor del 30% de los autores publican posteriormente versiones editadas basadas en los comentarios recibidos en el portal. Como resultado, la mayoría de los manuscritos enviados a bioRxiv se publican en revistas revisadas por pares.

Hasta noviembre de 2021, se han publicado en el portal más de 140.000 obras.

Historia

BioRxiv se lanzó a raíz de la popularidad de los repositorios de preprints en línea , el primero de los cuales fue creado por el físico del Laboratorio Nacional de Los Álamos Paul Ginsparg en 1991, el portal ArXiv.org (pronunciado [archivo]). Cuando se creó arXiv, la práctica de compartir preprints en el campo de la física era bastante común: los investigadores se enviaban con éxito sus informes no publicados sobre experimentos o borradores de artículos antes de su publicación en la revista. Tal intercambio hizo posible no solo recibir comentarios y críticas de colegas antes de revisar, sino también evitar la duplicación de datos o consolidar la primacía del descubrimiento [2] [3] . Pronto, arXiv ganó gran popularidad y, en julio de 2021, se publicaron alrededor de 1,9 millones de obras en el sitio [4] .

Inicialmente, arXiv.org aceptaba trabajos exclusivamente en el campo de la física, pero con un aumento en la demanda de otras ramas de la ciencia, en 2003 Ginsparg inició la creación de una sección separada para descargar preprints en biología cuantitativa, incluyendo estadísticas biológicas , bioinformática , población biología _ Al mismo tiempo, la revista de acceso abierto PeerJ abrió una sección separada para preprints de biología . Sin embargo, a pesar de la creciente popularidad de estas secciones en los repositorios (los artículos de biología alojados en arXiv fueron posteriormente publicados en Nature y PLOS Biology ), los portales no buscaron ampliar aún más las posibilidades de publicación de trabajos en esta área [5] [6] .

En 2013, el biólogo molecular Richard Sever del Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL), junto con su colega John Inglis, lanzaron un portal arXiv similar llamado bioRxiv alojado por HighWire [ [7] [5] . BioRxiv se afilió formalmente a CSHL [8] y sus objetivos principales eran acelerar la difusión del conocimiento y brindar oportunidades para comentarios críticos y retroalimentación sobre trabajos aún no publicados en biología [9] . Solo en el primer año de funcionamiento se subieron al portal 800 preprints [10] , y en total para el período de 2013 a 2016, unas 3.000 obras [11] . Para 2019, su número había aumentado a 40 000 [12] . A partir de noviembre de 2021, el portal contiene datos sobre más de 140 000 preprints [13] .

En 2016, bioRxiv firmó un acuerdo con Biophysical Journal , ELife , The EMBO Journal , EMBO Molecular Medicine , EMBO Reports , G3: Genes, Genomes, Genetics , Molecular Systems Biology , según el cual los autores de preprints publicados en el portal pueden enviar sus artículos para revisión directamente a través de bioRxiv sin tener que volver a cargar archivos y volver a ingresar información en el sitio web de la revista [11] .

El consejo asesor de bioRxiv incluye, entre otros, al creador de arXiv, Paul Ginsparg, y al cofundador de Google Academy , Anurag Acharya [9] .

Cómo funciona

Solo los manuscritos que no hayan sido publicados previamente en revistas científicas y que no hayan pasado por una revisión por pares pueden colocarse en bioRxiv. Al publicar un artículo, los autores pueden caracterizar su trabajo como nuevo, confirmar o refutar investigaciones científicas existentes y también elegir una de las 26 categorías temáticas. Después de enviar un artículo, los moderadores verifican si tiene contenido ofensivo o no científico, pero no editan ni revisan el texto en sí. Por lo general, los artículos se vuelven públicos a las pocas horas de haber sido cargados [14] . Posteriormente, los investigadores pueden publicar versiones revisadas del trabajo o agregar enlaces a publicaciones de revistas del preprint [9] .

A cada preprint se le asigna un DOI que, junto con otros datos de conteo de descargas de PDF y altmetric , está disponible para todos los usuarios. Cuando se publica un preprint como artículo en una revista científica, bioRxiv actualiza la versión anterior con un enlace a la publicación. Los artículos en bioRxiv están indexados por el motor de búsqueda de Google y Google Scholar, pero no están incluidos en el sistema PubMed , que almacena solo materiales revisados ​​por pares [14] .

A partir de 2016, la mayoría de los artículos publicados en bioRxiv fueron sobre biología evolutiva , genética y genómica [14] .

BioRxiv acepta artículos preimpresos que cubren todos los aspectos de la investigación biológica. Al publicar un artículo, el autor lo remite a una de las siguientes categorías [15] :

Influencia

En 2019, los investigadores analizaron 7087 artículos enviados a bioRxiv y compararon las medidas altmétricas con artículos no depositados. Los resultados mostraron que los preprints publicados en bioRxiv se citaron en promedio un 36 % más a menudo y tenían valores altmétricos un 49 % más altos [16] . Los datos obtenidos indican un impacto positivo a largo plazo de la publicación de preprints en el número de citas, y no solo en la tasa de aparición, como se demostró previamente en el análisis de artículos publicados en arXiv.org [16] [17] [16] .

Alrededor del 30% de los preprints publicados en bioRxiv permanecen sin publicar en revistas; se obtuvieron datos similares al analizar la actividad de publicación en arXiv. Al mismo tiempo, casi la mitad de los preprints de bioRxiv publicados posteriormente aparecen en las revistas Elsevier , Nature , Public Library of Science y Oxford University Press [12] . BioRxiv es más popular entre los investigadores de EE. UU . y el Reino Unido , con mucha menos popularidad en China , Rusia y Turquía [18] .

Notas

  1. ↑ WorldCat  (pl.) - 1971.
  2. ↑ Pinfield, 2001 .
  3. ↑ Vivienne Bachelet. ¿Qué son las preimpresiones? . Onda Med (2017). Consultado el 1 de mayo de 2021. Archivado desde el original el 11 de mayo de 2021.
  4. ↑ Envíos mensuales . Universidad de Cornell. Fecha de acceso: 2021-04-37. Archivado el 7 de mayo de 2021.
  5. ↑ 1 2Ewen Callaway. Los preprints cobran vida . Naturaleza (12 de noviembre de 2013). Consultado el 2 de julio de 2021. Archivado desde el original el 15 de diciembre de 2021.
  6. ↑ Ewen Callaway. Los genetistas observan el potencial de arXiv . Naturaleza (31 de julio de 2012). Consultado el 29 de junio de 2021. Archivado desde el original el 11 de agosto de 2021.
  7. ↑ HighWire a los 25: Richard Sever (bioRxiv) mira hacia atrás . High Wire (12 de agosto de 2020). Consultado el 5 de julio de 2021. Archivado desde el original el 9 de julio de 2021.
  8. ↑ El servidor de preimpresión para biología . CSHL (12 de noviembre de 2013). Consultado el 3 de julio de 2021. Archivado desde el original el 9 de julio de 2021.
  9. ↑ 1 2 3 Jocelyn Kaiser. El nuevo servidor de preimpresión pretende ser la respuesta de los biólogos al arXiv de los físicos . Ciencia (12 de noviembre de 2013). Consultado el 28 de junio de 2021. Archivado desde el original el 9 de julio de 2021.
  10. ↑ Jocelyn Kaiser. BioRxiv a 1 año: un comienzo prometedor . Ciencia (11 de noviembre de 2014). Consultado el 29 de junio de 2021. Archivado desde el original el 28 de julio de 2021.
  11. ↑ 1 2 preprints de bioRxiv ahora se pueden enviar directamente a revistas de investigación líderes . Organización de física (15 de enero de 2016). Consultado el 29 de junio de 2021. Archivado desde el original el 18 de marzo de 2018.
  12. ↑ 12 Anderson , 2019 .
  13. ↑ Todos los artículos . BioRxiv. Consultado el 22 de noviembre de 2021. Archivado desde el original el 21 de noviembre de 2021.
  14. ↑ 1 2 3 John Sever. bioRxiv: un informe de progreso . ASAP bio. Consultado el 29 de junio de 2021. Archivado desde el original el 9 de julio de 2021.
  15. ↑ Acerca de bioRxiv . bioRxiv. Consultado el 3 de julio de 2021. Archivado desde el original el 1 de diciembre de 2018.
  16. ↑ 1 2 3 Fraser, 2020 , pág. 618-636.
  17. ↑ Gema Conroy. Los preprints aumentan las citas y menciones de los artículos . Nature Index (9 de julio de 2019). Consultado el 3 de julio de 2021. Archivado desde el original el 9 de julio de 2021.
  18. ↑ Abdill, 2020 .

Literatura

Enlaces

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