Histona desacetilasa 6

Introducido basado en PDB 3C5K .

Estructuras Disponibles

Búsqueda de ortólogos: PDBe , RCSB

Lista de ID de PDB
3C5K , 3GV4 , 3PHD

Identificadores

Símbolo

HDAC6 ; CPBHM; HD6; PPP1R90

Identificaciones externas

OMIM: 300272 MGI : 1333752 HomoloGen : 31353 IUPHAR : ChEMBL : 1865 GeneCards : gen HDAC6

Número CE

3.5.1.98

Ontología de genes
Función	• unión a actina • actividad de histona desacetilasa • unión a proteínas • unión a beta-catenina • unión a microtúbulos • unión a iones de zinc • unión a enzimas • unión a poliubiquitina • actividad de histona desacetilasa dependiente de NAD (específica de H3-K14) • unión de histona desacetilasa • actividad de tubulina desacetilasa • alfa-tubulina unión • actividad de histona desacetilasa dependiente de NAD (específica de H3-K9) • actividad de histona desacetilasa dependiente de NAD (específica de H4-K16) • unión de proteína tau • unión de beta-tubulina • unión de proteína Hsp90 • unión de complejo de dineína • Actividad de histona desacetilasa dependiente de NAD (específica de H3-K18)
componente celular	• complejo de histona desacetilasa • núcleo • citoplasma • citosol • microtúbulos • complejo asociado a microtúbulos • microtúbulos citoplasmáticos • caveola • cuerpo de inclusión • agresoma • complejo de dineína • axón • dendrita • borde de ataque de la célula • pericarion • región perinuclear del citoplasma
proceso biológico	• poliubiquitinación de proteínas • transcripción, plantilla de ADN • desacetilación de proteínas • proceso catabólico de proteínas mal plegadas o sintetizadas de forma incompleta • transporte de proteínas intracelulares • regulación negativa de la despolimerización de microtúbulos • respuesta a sustancias tóxicas • regulación positiva de la transducción de señales • respuesta a sustancias orgánicas • regulación de la actividad del receptor • positivo regulación de la migración de células epiteliales • regulación negativa del proceso metabólico del peróxido de hidrógeno • regulación positiva del proceso biosintético del receptor • macroautofagia • desacetilación de histonas • localización de lisosomas • desacetilación de peptidil-lisina • respuesta celular a proteínas topológicamente incorrectas • proceso catabólico de proteínas dependiente de ubiquitina a través del multivesicular vía de clasificación del cuerpo • desmontaje del complejo proteico • regulación negativa del desmontaje del complejo proteico • regulación negativa de la proteólisis • regulación negativa de la transcripción, plantilla de ADN • regulación negativa de la actividad de la oxidorreductasa • respuesta a mi proteína plegada • regulación del movimiento basado en microtúbulos • regulación de la vía de señalización del receptor de andrógenos • regulación del establecimiento de la localización de proteínas • respuesta celular al peróxido de hidrógeno • ensamblaje agresivo • transporte de proteínas mal plegadas poliubiquitinadas • desacetilación de Hsp90 • respuesta al factor de crecimiento • desacetilación de histona H3 • desacetilación de la histona H4 • respuesta celular a la proteína mal plegada • regulación positiva del ensamblaje del complejo proteico mediado por chaperonas • desacetilación de la tubulina • regulación positiva de la muerte celular programada mediada por peróxido de hidrógeno
Fuentes: Amigo / QuickGO

perfil de expresión de ARN

Más información

ortólogos

Vista

Humano

Ratón

Entrez

RefSeq (ARNm)

RefSeq (proteína)

Lugar geométrico (UCSC)

Chr HG1436_HG1432_PATCH:
48.66 – 48.68 Mb

Cr X:
7.93 – 7.95 Mb

Buscar en PubMed

[una]

[2]

Histona desacetilasa 6 ( Histona desacetilasa 6 ) es una enzima codificada en humanos por el gen HDAC6 [1] [2] .

Función

Las histonas juegan un papel fundamental en la regulación de la transcripción , el ciclo celular y el proceso de desarrollo. La acetilación/desacetilación de histonas altera la estructura de la cromatina y afecta la transcripción. La histona desacetilasa 6 pertenece a la clase II de la familia histona desacetilasa/acuc/APHA. Contiene dos dominios catalíticos que funcionan independientemente uno del otro. La proteína tiene actividad histona desacetilasa e inhibe la transcripción [3] .

Relevancia clínica

Las mutaciones en este gen se han asociado con la enfermedad de Alzheimer [4] .

La sobreexpresión de esta proteína se correlaciona con la oncogénesis y la supervivencia celular, y también promueve la metástasis de las células cancerosas [5] .

Funciones

La histona desacetilasa 6 está implicada en el desmontaje de los cilios celulares , que es necesaria para el inicio de la mitosis [6] . También promueve la migración celular y cataliza la desacetilación de la α-tubulina [7] , que puede promover la metástasis del cáncer [5] . Influye en la transcripción y traducción al regular la proteína de choque térmico Hsp90 y los gránulos de estrés, respectivamente [5] .

Conocido por su alta afinidad por las proteínas ubiquitinadas [8] . La histona desacetilasa 6 juega un papel importante en la formación de gránulos de estrés ; con la inhibición o supresión farmacológica de la síntesis de histona desacetilasa 6 a nivel genético, se detiene la formación de gránulos de estrés.

Interacciones

Se ha demostrado que HDAC6 interactúa con HDAC11 [9] y ZBTB16 [10] .

HDAC6 también interactúa con la proteína de gránulos de estrés G3BP1 [8] .

Véase también

Histona desacetilasas

Notas

↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Tres proteínas definen una clase de histona desacetilasas humanas relacionadas con la levadura Hda1p // Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América : revista . - 1999. - Junio ( vol. 96 , n. 9 ). - Pág. 4868-4873 . -doi : 10.1073/ pnas.96.9.4868 . —PMID 10220385 .
↑ Nagase T., Ishikawa K., Suyama M., Kikuno R., Hirosawa M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Predicción de secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XII. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro // Investigación de ADN : diario. - 1999. - Mayo ( vol. 5 , no. 6 ). - P. 355-364 . -doi : 10.1093 / dnares/5.6.355 . —PMID 10048485 .
↑ Entrez Gene: HDAC6 histona desacetilasa 6 . (indefinido)
↑ Cook C., Gendron TF, Scheffel K., Carlomagno Y., Dunmore J., DeTure M., Petrucelli L. Loss of HDAC6, un nuevo sustrato CHIP, alivia la acumulación anormal de tau // Human Molecular Genetics : diario. - Oxford University Press , 2012. - 5 de abril. -doi : 10.1093 / hmg/dds125 . —PMID 22492994 .
↑ 1 2 3 Aldana-Masangkay GI, Sakamoto KM El papel de HDAC6 en el cáncer // BioMed Research International : diario. - 2011. - vol. 2011 _ - Pág. 875824 . -doi : 10.1155 / 2011/875824 . —PMID 21076528 .
↑ Gradilone SA , Radtke BN , Bogert PS , Huang BQ , Gajdos GB , LaRusso NF La inhibición de HDAC6 restaura la expresión ciliar y disminuye el crecimiento tumoral. (Inglés) // Investigación del cáncer. - 2013. - Vol. 73, núm. 7 . - Pág. 2259-2270. -doi : 10.1158 / 0008-5472.CAN-12-2938 . — PMID 23370327 .
↑ Gao YS, Hubbert CC, Lu J., Lee YS, Lee JY, Yao TP La histona desacetilasa 6 regula la endocitosis y la remodelación de actina inducida por el factor de crecimiento // Biología molecular y celular : diario. - 2007. - vol. 27 , núm. 24 . - Pág. 8637-8647 . -doi : 10.1128/ MCB.00393-07 . —PMID 17938201 .
↑ 1 2 Kwon S., Zhang Y., Matthias P. La desacetilasa HDAC6 es un nuevo componente crítico de los gránulos de estrés involucrados en la respuesta al estrés // Genes & Development : journal . - 2007. - diciembre ( vol. 21 , no. 24 ). - Pág. 3381-3394 . -doi : 10.1101/ gad.461107 . —PMID 18079183 .
↑ Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. Clonación y caracterización funcional de HDAC11, un nuevo miembro de la familia de histonas desacetilasas humanas // Journal of Biological Chemistry : revista. - 2002. - julio ( vol. 277 , no. 28 ). - Pág. 25748-25755 . -doi : 10.1074/ jbc.M111871200 . —PMID 11948178 .
↑ Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 media la represión transcripcional por la proteína PLZF asociada a la leucemia promielocítica aguda .) / / Oncogen : diario. - 2004. - noviembre ( vol. 23 , no. 54 ). - Pág. 8777-8784 . -doi : 10.1038 / sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .

Literatura

Pazin MJ, Kadonaga JT ¿Qué pasa con la desacetilación y transcripción de histonas? (inglés) // Celular : diario. - Cell Press , 1997. - vol. 89 , núm. 3 . - P. 325-328 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80211-1 . — PMID 9150131 .
Wolffe AP Control transcripcional. Represión pecaminosa (inglés) // Nature. - 1997. - vol. 387 , núm. 6628 . - Pág. 16-7 . -doi : 10.1038/ 387016a0 . — PMID 9139815 .
Huynh KD, Fischle W., Verdin E., Bardwell VJ BCoR, un nuevo correpresor involucrado en la represión de BCL-6 // Genes & Development : journal . - 2000. - vol. 14 , núm. 14 _ - Pág. 1810-1823 . -doi : 10.1101/ gad.14.14.1810 . —PMID 10898795 .
Mahlknecht U., Schnittger S., Landgraf F., Schoch C., Ottmann OG, Hiddemann W., Hoelzer D. Asignación del gen de la histona deacetilasa 6 humana (HDAC6) al cromosoma X p11.23 mediante hibridación in situ (ing. ) // Citogenética e investigación del genoma : diario. - 2001. - vol. 93 , núm. 1-2 . - P. 135-136 . -doi : 10.1159/ 000056967 . —PMID 11474198 .
Kao HY, Lee CH, Komarov A., Han CC, Evans RM Aislamiento y caracterización de HDAC10 de mamíferos, una nueva histona desacetilasa (inglés) // Journal of Biological Chemistry : revista. - 2002. - vol. 277 , núm. 1 . - pág. 187-193 . -doi : 10.1074/ jbc.M108931200 . —PMID 11677242 .
Seigneurin-Berny D., Verdel A., Curtet S., Lemercier C., Garin J., Rousseaux S., Khochbin S. Identificación de componentes del complejo murino histona desacetilasa 6: vínculo entre la acetilación y las vías de señalización de ubiquitinación ) // Biología Molecular y Celular : diario. - 2001. - vol. 21 , núm. 23 . - Pág. 8035-8044 . -doi : 10.1128/ MCB.21.23.8035-8044.2001 . —PMID 11689694 .
Tong JJ, Liu J., Bertos NR, Yang XJ Identificación de HDAC10, una nueva histona desacetilasa humana de clase II que contiene un dominio rico en leucina // Investigación de ácidos nucleicos : diario. - 2002. - vol. 30 , núm. 5 . - P. 1114-1123 . doi : 10.1093/nar/ 30.5.1114 . —PMID 11861901 .
Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. Clonación y caracterización funcional de HDAC11, un nuevo miembro de la familia de histonas desacetilasas humanas // Journal of Biological Chemistry : revista. - 2002. - vol. 277 , núm. 28 . - Pág. 25748-25755 . -doi : 10.1074/ jbc.M111871200 . —PMID 11948178 .
Hubbert C., Guardiola A., Shao R., Kawaguchi Y., Ito A., Nixon A., Yoshida M., Wang XF, Yao TP HDAC6 es una desacetilasa asociada a microtúbulos // Nature . - 2002. - vol. 417 , núm. 6887 . - P. 455-458 . -doi : 10.1038/ 417455a . —PMID 12024216 .
Kirsh O., Seeler JS, Pichler A., Gast A., Müller S., Miska E., Mathieu M., Harel-Bellan A., Kouzarides T., Melchior F., Dejean A. La ligasa SUMO E3 RanBP2 promueve la modificación de la desacetilasa HDAC4 // The EMBO Journal : diario. - 2002. - vol. 21 , núm. 11 _ - Pág. 2682-2691 . -doi : 10.1093 / emboj/21.11.2682 . —PMID 12032081 .
Hook SS, Orian A., Cowley SM, Eisenman RN La histona desacetilasa 6 se une a la poliubiquitina a través de su dedo de zinc (dominio PAZ) y se copurifica con enzimas desubiquitinantes // Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América : revista. - 2002. - vol. 99 , núm. 21 . - Pág. 13425-13430 . -doi : 10.1073/ pnas.172511699 . — PMID 12354939 .
Westendorf JJ, Zaidi SK, Cascino JE, Kahler R., van Wijnen AJ, Lian JB, Yoshida M., Stein GS, Li X. Runx2 (Cbfa1, AML-3) interactúa con la histona desacetilasa 6 y reprime el promotor p21CIP1/WAF1 (Español) // Biología Molecular y Celular : diario. - 2002. - vol. 22 , núm. 22 . - Pág. 7982-7992 . -doi : 10.1128/ MCB.22.22.7982-7992.2002 . — PMID 12391164 .
North BJ, Marshall BL, Borra MT, Denu JM, Verdin E. El ortólogo Sir2 humano, SIRT2, es una tubulina desacetilasa dependiente de NAD+ // Molecular Cell : diario. - 2003. - vol. 11 , núm. 2 . - Pág. 437-444 . - doi : 10.1016/S1097-2765(03)00038-8 . — PMID 12620231 .
Voelter-Mahlknecht S., Mahlknecht U. Clonación y caracterización estructural del gen de la histona desacetilasa 6 humana // International Journal of Molecular Medicine : diario. - 2004. - vol. 12 , núm. 1 . - P. 87-93 . -doi : 10.3892 / ijmm.12.1.87 . — PMID 12792815 .
Brush MH, Guardiola A., Connor JH, Yao TP, Shenolikar S. Los inhibidores de la desacetilasa interrumpen los complejos celulares que contienen proteínas fosfatasas y desacetilasas // Journal of Biological Chemistry : revista. - 2004. - vol. 279 , núm. 9 _ - Pág. 7685-7691 . -doi : 10.1074/ jbc.M310997200 . —PMID 14670976 .
Pandey UB, Batlevi Y., Baehrecke EH, Taylor JP HDAC6 en la intersección de la autofagia, el sistema de ubiquitina-proteasoma y la neurodegeneración (inglés) // Autofagia: revista. — vol. 3 , núm. 6 _ - Pág. 643-645 . -doi : 10.4161/ auto.5050 . —PMID 17912024 . (Epub 10 de septiembre de 2007)
Pandey UB, Nie Z., Batlevi Y., McCray BA, Ritson GP, Nedelsky NB, Schwartz SL, DiProspero NA, Knight MA, Schuldiner O., Padmanabhan R., Hild M., Berry DL, Garza D., Hubbert CC, Yao TP, Baehrecke EH, Taylor JP HDAC6 rescata la neurodegeneración y proporciona un vínculo esencial entre la autofagia y la UPS // Nature: revista. - 2007. - 14 de junio ( vol. 447 , no. 7146 ). - P. 859-863 . -doi : 10.1038/ naturaleza05853 . — PMID 17568747 .