5-hidroximetilcitosina

5-​Hidroximetilcitosina
General

Nombre sistemático		 6-​amino-​5-​​(hidroximetil)​-​1 H -​pirimidin-​2-​ona
abreviaturas 5 hmC
nombres tradicionales Hidroximetilcitosina
química fórmula C 5 H 7 N 3 O 2
Propiedades físicas
Masa molar 141,13 g/ mol
Clasificación
registro número CAS 1123-95-1
PubChem 70751
SONRISAS   C1=NC(=O)NC(=C1CO)N
InChI   InChI=1S/C5H7N3O2/c6-4-3(2-9)1-7-5(10)8-4/h1.9H,2H2,(H3,6,7,8,10)RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N
CHEBI 76792
ChemSpider 63916
Los datos se basan en condiciones estándar (25 °C, 100 kPa) a menos que se indique lo contrario.

La 5-hidroximetilcitosina es una base de pirimidina  nitrogenada formada a partir de citosina mediante la adición de un grupo metilo y luego un grupo hidroxilo en la quinta posición. Participa en la regulación epigenética de la expresión génica durante la diferenciación celular y el desarrollo embrionario. Se cree que la 5-hidroximetilcitosina surge de la desmetilación activa de la 5-metilcitosina por su oxidación con la participación de las proteínas Tet [1] [2] . La 5-hidroximetilcitosina se identificó por primera vez en bacteriófagos en 1952 [3] [4] , en 2009 se encontró 5-hidroximetilcitosina en células cerebrales [5] y en células madre embrionarias humanas y de ratón [1] .

Localización

En desarrollo, la 5-hidroximetilcitosina ya se detecta en la etapa de cigoto . La oxidación de metilcitosina a hidroximetilcitosina ocurre en la etapa de cigoto en el pronúcleo paterno, pero no en el materno. Además, durante las primeras divisiones, continúa observándose la "asimetría" parental en 5-hidroximetilcitosina, lo que permite distinguir entre los cromosomas maternos y paternos hasta la etapa de aplastamiento [6] . En el desarrollo embrionario posterior, se observa un alto nivel de 5-hidroximetilcitosina en la masa celular interna del blastocisto ; en la etapa posterior a la implantación, la 5-hidroximetilcitosina se colocaliza con las células que expresan nestina [7] .

Se supone que la 5-hidroximetilcitosina se puede encontrar en el núcleo de cualquier célula de mamífero , pero su cantidad varía significativamente según el tipo de célula. En el cuerpo adulto, el nivel más alto se encuentra en las células neuronales del sistema nervioso central [8] [9] [10] . Como se muestra en las células neuronales de ratón, la cantidad de hidroximetilcitosina en el hipocampo y el cerebelo aumenta con la edad [8] [11] .

Véase también

Notas

  1. ↑ 1 2 Tahiliani M., Koh KP, Shen Y., et al. Conversión de 5-metilcitosina a 5-hidroximetilcitosina en ADN de mamíferos por el socio de MLL TET1  //  Science. - 2009. - mayo ( vol. 324 , no. 5929 ). - Pág. 930-935 . -doi : 10.1126 / ciencia.1170116 . — PMID 19372391 .
  2. ↑ Ito S., D'Alessio AC, Taranova OV, Hong K., Sowers LC, Zhang Y. Rol de las proteínas Tet en la conversión de 5mC a 5hmC, autorrenovación de células ES y   especificación de masa celular interna // - 2010. - Agosto ( vol. 466 , no. 7310 ). - P. 1129-1133 . -doi : 10.1038 / nature09303 . —PMID 20639862 .
  3. ↑ Warren RA Bases modificadas en ADN de bacteriófagos  (sin definir)  // Annu. Rvdo. microbiol . - 1980. - T. 34 . - S. 137-158 . -doi : 10.1146 / annurev.mi.34.100180.001033 . —PMID 7002022 .
  4. ↑ Wyatt GR, Cohen SS Una nueva base de pirimidina a partir de ácidos nucleicos de bacteriófagos  (inglés)  // Nature: journal. - 1952. - Diciembre ( vol. 170 , no. 4338 ). - P. 1072-1073 . -doi : 10.1038/ 1701072a0 . —PMID 13013321 .
  5. ↑ Kriaucionis S., Heintz N. La base de ADN nuclear 5-hidroximetilcitosina está presente en las neuronas de Purkinje y el cerebro  //  Ciencia: revista. - 2009. - mayo ( vol. 324 , no. 5929 ). - Pág. 929-930 . -doi : 10.1126 / ciencia.1169786 . —PMID 19372393 .
  6. ↑ Iqbal K., Jin SG, Pfeifer GP, Szabó PE La reprogramación del genoma paterno tras la fertilización implica la oxidación de 5-metilcitosina en todo el genoma   // Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América  : revista. - 2011. - marzo ( vol. 108 , no. 9 ). - Pág. 3642-3647 . -doi : 10.1073/ pnas.1014033108 . —PMID 21321204 . Archivado desde el original el 5 de noviembre de 2017.
  7. ↑ Ruzov A., Tsenkina Y., Serio A., et al. Distribución específica de linaje de altos niveles de 5-hidroximetilcitosina genómica en el desarrollo de mamíferos  // Cell Res  . : diario. - 2011. - Septiembre ( vol. 21 , no. 9 ). - P. 1332-1342 . -doi : 10.1038/ cr.2011.113 . — PMID 21747414 . Archivado desde el original el 4 de octubre de 2011.
  8. ↑ 1 2 Münzel M et al. Cuantificación de la Sexta Base de ADN Hidroximetilcitosina en el Cerebro   // Angew . química En t. ed.  : diario. - 2010. - julio ( vol. 49 , no. 31 ). - Pág. 5375-5377 . - doi : 10.1002/anie.201002033 .
  9. ↑ Szwagierczak A et al. Cuantificación enzimática sensible de 5-hidroximetilcitosina en ADN genómico  // Ácidos nucleicos Res  . : diario. - 2010. - Octubre ( vol. 38 , no. 19 ). — Pág. e181 . doi : 10.1093 / nar/gkq684 . —PMID 20685817 .
  10. ↑ Globisch D et al. Distribución tisular de 5-hidroximetilcitosina y búsqueda de intermediarios activos de desmetilación  (inglés)  // PLoS ONE  : revista / Croft, Anna Kristina. - 2010. - Diciembre ( vol. 5 , no. 12 ). — Pág. e15367 . - doi : 10.1371/journal.pone.0015367 . — PMID 21203455 .
  11. ↑ Song CX et al. El etiquetado químico selectivo revela la distribución en todo el genoma de la 5-hidroximetilcitosina   // Nat . Biotecnología. : diario. - 2010. - Diciembre ( vol. 29 , no. 1 ). - Pág. 68-72 . -doi : 10.1038/ nbt.1732 .