DDX5

Caja helicasa MUERTA (Asp-Glu-Ala-Asp) 5
Estructuras Disponibles
AP Búsqueda de ortólogos: PDBe , RCSB
Identificadores
SímboloDDX5  ; G17P1; HLR1; JOROBA68; p68
Identificaciones externasOMIM:  180630 MGI :  105037 HomoloGene :  6797 GeneCards : Gen DDX5
Número CE3.6.4.13
perfil de expresión de ARN
Más información
ortólogos
VistaHumanoRatón
Entrez165513207
ConjuntoENSG00000108654ENSMUSG00000020719
UniProtP17844Q61656
RefSeq (ARNm)NM_004396NM_007840
RefSeq (proteína)NP_004387NP_031866
Lugar geométrico (UCSC)Canal 17:
62,5 – 62,5 Mb
Canal 11:
106,78 – 106,79 Mb
Buscar en PubMed[una][2]

La supuesta ARN helicasa DDX5 dependiente de ATP , también conocida como proteína de caja DEAD 5 o ARN helicasa p68,  es una enzima codificada en humanos por el gen DDX5 [1] .

Función

Las proteínas Box DEAD , caracterizadas por un motivo conservado Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), son presumiblemente helicasas de ARN . Están involucrados en muchos procesos celulares, como cambios en la estructura secundaria del ARN, iniciación de la traducción, empalme nuclear y mitocondrial , ensamblaje de ribosomas y espliceosomas . Según sus patrones de distribución, se cree que algunos miembros de esta familia están involucrados en la embriogénesis , la espermatogénesis y el crecimiento y la división celular. Este gen codifica la proteína DEAD box, que es una ATPasa dependiente de ARN , así como un antígeno nuclear asociado a la proliferación que responde específicamente al antígeno tumoral del virus simio 40. Este gen consta de 13 exones , hay varias variantes de empalme que contienen secuencias de intrones , pero estas transcripciones no fueron detectadas [1] .

Interacciones

Se ha demostrado que DDX5 interactúa con:

Notas

  1. 1 2 Entrez Gene: polipéptido de caja DDX5 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) 5 .
  2. Akileswaran L., Taraska JW, Sayer JA, Gettemy JM, Coghlan VM La proteína de anclaje de la cinasa A AKAP95 está dirigida a la matriz nuclear y se asocia con la helicasa de ARN p68  //  J. Biol. química  : diario. - 2001. - mayo ( vol. 276 , n. 20 ). - Pág. 17448-17454 . -doi : 10.1074/ jbc.M101171200 . — PMID 11279182 .
  3. Ogilvie VC, Wilson BJ, Nicol SM, Morrice NA, Saunders LR, Barber GN, Fuller-Pace FV Las helicasas p68 y p72 de ARN de caja DEAD altamente relacionadas existen como heterodímeros en las células  // Nucleic Acids Res  . : diario. - 2003. - marzo ( vol. 31 , no. 5 ). - P. 1470-1480 . -doi : 10.1093 / nar/gkg236 . — PMID 12595555 .
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  8. Wilson BJ, Bates GJ, Nicol SM, Gregory DJ, Perkins ND, Fuller-Pace FV Las helicasas de ARN p68 y p72 DEAD box interactúan con HDAC1 y reprimen la transcripción de manera específica del promotor  //  BMC Mol. Biol. : diario. - 2004. - Agosto ( vol. 5 ). — Pág. 11 . -doi : 10.1186/ 1471-2199-5-11 . — PMID 15298701 .
  9. 1 2 3 Watanabe M., Yanagisawa J., Kitagawa H., Takeyama K., Ogawa S., Arao Y., Suzawa M., Kobayashi Y., Yano T., Yoshikawa H., Masuhiro Y., Kato S. Una subfamilia de proteínas DEAD-box de unión a ARN actúa como un coactivador del receptor de estrógeno α a través del dominio de activación N-terminal (AF-1) con un coactivador de ARN, SRA  // EMBO  J. : diario. - 2001. - marzo ( vol. 20 , no. 6 ). - P. 1341-1352 . -doi : 10.1093 / emboj/20.6.1341 . — PMID 11250900 .
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  11. Yao H., Brick K., Evrard Y., Xiao T., Camerini-Otero RD, Felsenfeld G. Mediación del aislamiento transcripcional de CTCF por la proteína p68 de unión a ARN de la caja DEAD y el activador de ARN del receptor de esteroides   SRA // Genes Dev  : diario. - 2010. - Vol. 24 , núm. 22 . - Pág. 2543-2555 . -doi : 10.1101/ gad.1967810 . — PMID 20966046 .

Literatura