Bacterioclorofilas

Las bacterioclorofilas  son un grupo heterogéneo de pigmentos de tetrapirrol fotosintéticos que son sintetizados por varias bacterias fototróficas anoxigénicas que realizan la fotosíntesis sin evolución de oxígeno .

Las propiedades espectrales de las bacterioclorofilas en las células difieren significativamente de las soluciones y están determinadas por las interacciones no covalentes de sus moléculas con las proteínas que las contienen, así como entre sí.

Estructura química de las bacterioclorofilas

Las bacterioclorofilas a , byg  son bacterioclorinas , es decir, contienen un macrociclo de bacterioclorinas con dos anillos pirrol reducidos (II y IV).

Las bacterioclorofilas c-f , como las clorofilas, tienen un anillo de macrociclo de cloro con un solo anillo de pirrol IV completamente reducido. A diferencia de todas las demás clorofilas y bacterioclorofilas, carecen del residuo -COOCH 3 en la posición R 5 , que es característico de todas las demás clorofilas y bacterioclorofilas. Cada una de estas bacterioclorofilas tiene varias formas, diferenciándose en los radicales R 3 y R 4 , así como en el alcohol esterificante R 5 [1] [2] .

Nombre Estructura R1 _ R2 _ R3 _ Comunicación C7-C8 R4 _ R5 R6 _ R7 _
Bacterioclorofila a –CO–CH 3 –CH3a _ _ –CH 2 CH 3 único -CH 3 -CO-O-CH 3 -mecha

-geranilgeranil

-H
Bacterioclorofila  b -CO-CH 3 -CH3a _ _ =CH-CH 3 único –CH3 _ –CO–O–CH 3 -mecha –H
Bacterioclorofila c –CHOH– CH3 –CH3 _ –C 2 H 5 b
–C 3 H 7
–C 4 H 9
doble –CH 3
–C 2 H 5
–H Farnezil, etc –CH3 _
Bacterioclorofila d –CHOH– CH3 –CH3 _ –C 2 H 5 b
–C 3 H 7
–C 4 H 9
doble –CH 3
–C 2 H 5
–H Farnezil, etc –H
Bacterioclorofila e –CHOH– CH3 –CHO –C 2 H 5 b
–C 3 H 7
–C 4 H 9
doble –CH 3
–C 2 H 5
–H Farnezil, etc –CH3 _
Bacterioclorofila f –CHOH– CH3 –CHO –C 2 H 5 b
–C 3 H 7
–C 4 H 9
doble ––CH 3
–C 2 H 5
–H Farnezil, etc –H
Bacterioclorofila g –CH = CH2 –CH3a _ _ \u003d CH-CH 2 único –CH3 _ –CO–O–CH 3 –geranilgeranil –H

Propiedades químicas

Las bacterioclorofilas son inestables a la luz, ácidos y agentes oxidantes. En disolventes polares (por ejemplo, en metanol), se alomerizan fácilmente; en presencia de ácidos, pierden el átomo central de magnesio (son feofitinizados) y/o el residuo esterificante (fitol/farnesol/geranilgeriniol, etc.) [3] .

Las bacterioclorofilas b   y g , que tienen un residuo de etilideno en C-8, se isomerizan en un medio ligeramente ácido para formar clorinas. La bacterioclorofila g es especialmente fácil de isomerizar , dando como resultado la clorofila a G [4] .

Bajo la acción del oxígeno en las moléculas de las bacterioclorofilas, se produce una ruptura oxidativa del anillo V de cinco miembros; en el futuro, los residuos de ácido formados en los átomos C-13 y C-14 pueden volver a cerrarse en un anillo de anhídrido de seis miembros con la formación de bacteriopurpurinas o purpurinas [3] [5] .  

Biosíntesis

En la figura se muestra un esquema simplificado para la biosíntesis de bacterioclorofillidas a, b y g , así como (E,M)-bacterioclorofilidas c-e [6] [7] .

Anteriormente, se suponía que el primer paso en la biosíntesis de las bacterioclorofilas c-e, la formación del anillo V sin un sustituyente carboximetilo en C13 2 , puede ocurrir incluso antes de la formación de 3,8-divinil-protoclorofilida a [8] . Actualmente, esto se considera improbable [6] [9] .

La última etapa de la biosíntesis, la conversión de bacterioclorofillidas en bacterioclorofilas, se lleva a cabo con la ayuda de esterasas codificadas por los genes BchG en las bacterioclorofilas a, byg y BchK en clorobio-clorofilas. En la síntesis de formas metiladas de bacterioclorofilas c-e , también participan la metilasa C12 1 -carbono BchR y C8 2 -metilasa BchQ. Aparentemente, sus sustratos son cualquier clorofilida con un residuo de hidroximetilo en C3, es decir, la metilación puede ocurrir en cualquier etapa después de la formación de 8-etil-12-metil-bacterioclorofilida d .

Distribución

El pigmento más ampliamente distribuido de las bacterias fototróficas anoxigénicas es la bacterioclorofila a . Es el pigmento de cloro predominante en los centros de reacción de la mayoría de las proteobacterias fototróficas, todas las bacterias verdes del azufre (Chlorobiaceae) y las fotótrofas anoxigénicas filamentosas (Chloroflexia). En algunas proteobacterias fototróficas, la bacterioclorofila a se reemplaza completamente por la bacterioclorofila b . La bacterioclorofila g se encuentra en un solo grupo de bacterias, pequeño en términos de número de especies y distribución, las heliobacterias .

Las bacterioclorofilas c-f están presentes exclusivamente en los clorosomas, complejos especiales de antenas fotosintéticas que se encuentran en todas las bacterias verdes del azufre (Chlorobiales) , algunos fotótrofos anoxigénicos filamentosos (Chloroflexia), así como en la acidobacteria fotoheterótrofa recientemente descubierta Chloracidobacterium thermophilum [10] .

Pigmento grupo de bacterias Máxima absorción infrarroja in vivo ( nm )
Bacterioclorofila  a Bacterias moradas (mayoritarias), Chlorobiaceae, Chloroflexales y Chloracidobacterium thermophilum 805-815, 830-890
Bacterioclorofila b Bacterias moradas (algunas) 835-850, 1020-1040
Bacterioclorofila c Chlorobiaceae (cepas verdes) la mayoría Chloroflexia , Chloracidibacterium thermophilum 745-755
Bacterioclorofila  d cepas verdes de Chlorobiaceae , Chloronema ( Chloroflexia ) 705-740
Bacterioclorofila e cepas marrones de Chlorobiaceae 719-726
Bacterioclorofila f algunas cepas de laboratorio de Chlorobiaceae ~705-707
Bacterioclorofila g Heliobacteria 670-788

Notas

  1. Scheer, H. (2006). Una descripción general de las clorofilas y las bacterioclorofilas: bioquímica, biofísica, funciones y aplicaciones   En: B. Grimm et al. (eds): Clorofilas y Bacterioclorofilas. Springer Países Bajos. (págs. 1-26)
  2. Orf, GS, Blankenship, RE (2013). Complejos de antena de clorosoma de bacterias fotosintéticas verdes. Investigación de la fotosíntesis ,  116 (2-3), p. 15-331.
  3. 1 2 Keely, BJ (2006). Geoquímica de las clorofilas. En  Clorofilas y Bacterioclorofilas  (pp. 535-561). Springer Países Bajos.
  4. Kobayashi, M., Hamano, T., Akiyama, M., Watanabe, T., Inoue, K., Oh-oka, H., Amesz J., Yamamura M., Kise, H. (1998). Isomerización independiente de la luz de bacterioclorofila g a clorofila a catalizada por ácidos débiles in vitro. Analytica chimica acta ,  365 (1), 199-203.
  5. Grin, MA y Mironov, AF (2008). Bacterioclorinas Sintéticas y Naturales: Síntesis, Propiedades y Aplicaciones. En: Procesos Químicos con Participación de Compuestos Biológicos y Afines: Aspectos Biofísicos y Químicos de Porfirinas, Pigmentos, Fármacos, Polímeros Biodegradables y Nanofibras , 5.
  6. 1 2 Liu, Z. y Bryant, D. A. (2011). Identificación de un gen esencial para el primer paso comprometido en la biosíntesis de bacterioclorofila c. Revista de química biológica ,  286 (25), 22393-22402.
  7. Tsukatani Y., Yamamoto H., Harada J., Yoshitomi T., Nomata J., Kasahara M., Mizoguchi T., Fujita Y., Tamiaki H. (2013). Una vía biosintética inesperadamente ramificada para la bacterioclorofila b es capaz de absorber la luz del infrarrojo cercano. Informes científicos ,  3 .
  8. Frigaard, NU, Chew, AGM, Maresca, JA y Bryant, D.A. (2006). Biosíntesis de bacterioclorofila en bacterias verdes. En  Clorofilas y Bacterioclorofilas  (pp. 201-221). Springer Países Bajos.
  9. Harada, J., Teramura, M., Mizoguchi, T., Tsukatani, Y., Yamamoto, K. y Tamiaki, H. (2015). Conversión estereoquímica del grupo C3-vinilo al grupo 1-hidroxietilo en la bacterioclorofila c por las hidratasas BchF y BchV: adaptación de las bacterias del azufre verde a entornos con luz limitada. Microbiología molecular ,  98 (6), 1184-1198.
  10. Bryant, Donald A.; Costas, AM; Maresca, JA & Chew, AG (2007-07-27), Candidatus Chloracidobacterium thermophilum: An Airobic Phototrophic Acidobacterium , Science T. 317 (5837): 523–526, PMID 17656724 , doi : 10.1126/science.1143236 , < http: //www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/317/5837/523 > Archivado el 14 de septiembre de 2009 en Wayback Machine .