Proteína 4 que contiene bromodominio

Proteína 4 que contiene bromodominio
Estructuras Disponibles
APBúsqueda humana UniProt: PDBe RCSB
Identificadores
simbolos BRD4 , CAP, HUNK1, HUNKI, MCAP, bromodominio que contiene 4
Identificaciones externas OMIM: 608749 HomoloGen: 137685 GeneCards: 23476
Objetivo de la droga
nombre de la droga Referencias
Viroporina 3a [SARS-CoV-2]
perfil de expresión de ARN


Más información
ortólogos
Tipos Humano Ratón
Entrez
Conjunto
UniProt
RefSeq (ARNm)

NM_014299
NM_058243
NM_001330384
NM_001379291
NM_001379292

n / A

RefSeq (proteína)

NP_001317313
NP_055114
NP_490597
NP_001366220
NP_001366221

n / A

Lugar geométrico (UCSC) Chr 19: 15.24 – 15.33 Mb n / A
Búsqueda en PubMed [2] n / A
Editar (humano)

La proteína 4 que contiene bromodominio ( BRD4) es una proteína de unión a cromatina  codificada por el gen BRD4 en humanos . Reconoce y se une a residuos de lisina acetilada en histonas y otras proteínas. BRD4 participa en la regulación de la transcripción y transmisión de información epigenética durante la división celular [1] . En 2016, se descubrió que BRD4 tenía su propia actividad histona acetil transferasa [2] .

BRD4 pertenece a la familia de proteínas BET que contiene dos bromodominios en tándem y un dominio extraterminal . Además de BRD4, esta familia incluye otras tres proteínas humanas: BRD2, BRD3 y BRDT [3] .

Distribución y localización intracelular

El ARN y la proteína de BRD4 están presentes en la gran mayoría de los tipos de células y tejidos [4] [3] .

BRD4 se localiza principalmente en el núcleo celular , pero también puede estar presente en el citoplasma en pequeñas cantidades [1] .

Estructura de genes y proteínas

Como resultado del empalme alternativo , se forman dos isoformas de la proteína. La isoforma más larga y común consta de 1362 residuos de aminoácidos y tiene un peso molecular de aproximadamente 152 kDa . La actividad biológica de BRD4 está asociada con esta isoforma particular. La segunda isoforma se acorta desde el extremo C-terminal, consta de 723 residuos de aminoácidos y tiene un peso molecular de 88 kDa. La isoforma corta se encuentra con mucha menos frecuencia que la isoforma larga y se desconoce su función [3] [1] .

BRD4 contiene dos bromodominios conservados en el extremo N de la molécula. Los bromodominios consisten en cuatro hélices α conectadas por bucles móviles. Juntos, las hélices y los bucles forman un bolsillo hidrofóbico que reconoce los residuos de acetilisina en las proteínas [5] .

El dominio extraterminal C-terminal de BRD4 está implicado en la unión del factor de transcripción P-TEFb [5] .

Funciones

Papel en la transcripción

BRD4 actúa como un regulador global de la transcripción y puede actuar de varias formas, pasiva y activamente.

La transcripción de una proporción significativa de los genes de los organismos multicelulares se detiene en la etapa de elongación temprana , cuando la longitud del pre-ARNm sintetizado es de unos 60 nucleótidos [6] . Una de las razones de tal interrupción es la unión secuencial de los factores reguladores negativos DSIF ( factor inductor de sensibilidad DRB ) y NELF ( factor de elongación negativa ) al complejo de transcripción ,  que bloquean el avance adicional de la ARN polimerasa II . El reinicio de la transcripción se lleva a cabo con la participación del factor P-TEFb. P-TEFb es un heterodímero que consta de cinasa 9 dependiente de ciclina y su subunidad reguladora, ciclina T1, T2 o K. P-TEFb fosforila DSIF y NELF y, por lo tanto, inhibe su actividad. Además, P-TEFb fosforila las repeticiones heptadas en el dominio C-terminal de la ARN polimerasa II en la posición Ser - 2, lo que también promueve la elongación activa [5] . BRD4 es responsable del reclutamiento de P-TEFb en el complejo de transcripción, que se une a las regiones cercanas al promotor de los genes al interactuar con los residuos de acetilisina en las histonas [7] [8] .  

BRD4 es una proteína quinasa atípica : es capaz de fosforilar de forma independiente la ARN polimerasa II en la posición Ser-2 en ausencia de una clara homología estructural con otras proteínas quinasas [9] .

Papel en la transcripción de genes individuales

BRD4 estimula la transcripción del gen CD274 que codifica la proteína PD-L1, independiente de MYC. Utilizando como ejemplo el cáncer de ovario y el linfoma de células B , se ha demostrado que el uso de inhibidores de BRD4, como JQ1 , conduce a una disminución de la cantidad de PD-L1 en la superficie de las células tumorales e induce una proliferación de células T. respuesta inmune contra ellos [10] [11] .

Papel en la regulación de la estructura de la cromatina

En 2016, se descubrió que BRD4 era una histoacetiltransferasa [2] . Acetila residuos de lisina en los fragmentos N-terminales de las histonas 3 y 4, así como el residuo Lys-122 en la histona 3. La acetilación de este último residuo tiene un efecto más significativo en la desestabilización del nucleosoma , porque se encuentra en el C globular -Dominio histónico terminal y en contacto directo con el ADN . Solo se conocen otras dos histoacetiltransferasas que pueden acetilar Lys-122 en la histona 3: p300 y CBP. La actividad histona acetiltransferasa de BRD4 provoca la descompactación de la cromatina (y por lo tanto estimula la transcripción) en muchas regiones del genoma , incluida la región de los genes MYC , FOS y AURKB .

Papel en la enfermedad humana

Por primera vez, el papel especial de BRD4 en enfermedades humanas se describió en el análisis de un tipo raro de carcinoma caracterizado por una translocación cromosómica t(15;19) [12] . Esta translocación fusiona la primera mitad del gen BRD4 y casi toda la región codificante del gen NUT [13] . Como resultado, se forma la oncoproteína quimérica BRD4-NUT, responsable de la naturaleza inusualmente agresiva de este carcinoma [14] .

Notas

  1. 1 2 3 BRD4 en la base de datos UniProt . Consultado el 11 de septiembre de 2014. Archivado desde el original el 2 de septiembre de 2017.
  2. 1 2 Devaiah BN , Case-Borden C. , Gegonne A. , Hsu CH , Chen Q. , Meerzaman D. , Dey A. , Ozato K. , Singer DS BRD4 es una histona acetiltransferasa que expulsa los nucleosomas de la cromatina.  (Inglés)  // Biología estructural y molecular de la naturaleza. - 2016. - doi : 10.1038/nsmb.3228 . — PMID 27159561 .
  3. 1 2 3 Wu SY , Chiang CM El adaptador de cromatina doble que contiene bromodominio Brd4 y la regulación transcripcional.  (Inglés)  // El Diario de química biológica. - 2007. - vol. 282, núm. 18 _ - Pág. 13141-13145. -doi : 10.1074/ jbc.R700001200 . — PMID 17329240 .
  4. BRD4 en el sitio web Human Protein Atlas . Consultado el 11 de septiembre de 2014. Archivado desde el original el 19 de julio de 2014.
  5. 1 2 3 Shi J. , Vakoc CR Los mecanismos detrás de la actividad terapéutica de la inhibición del bromodominio BET.  (Inglés)  // Célula molecular. - 2014. - Vol. 54, núm. 5 . - Pág. 728-736. -doi : 10.1016/ j.molcel.2014.05.016 . — PMID 24905006 .
  6. Kwak H. , Lis JT Control de elongación transcripcional.  (Inglés)  // Revisión anual de genética. - 2013. - Vol. 47. - Pág. 483-508. -doi : 10.1146 / annurev-genet-110711-155440 . —PMID 24050178 .
  7. Jang MK , Mochizuki K. , Zhou M. , Jeong HS , Brady JN , Ozato K. La proteína de bromodominio Brd4 es un componente regulador positivo de P-TEFb y estimula la transcripción dependiente de la ARN polimerasa II.  (Inglés)  // Célula molecular. - 2005. - vol. 19, núm. 4 . - Pág. 523-534. -doi : 10.1016/ j.molcel.2005.06.027 . — PMID 16109376 .
  8. Yang Z. , Yik JH , Chen R. , He N. , Jang MK , Ozato K. , Zhou Q. Reclutamiento de P-TEFb para la estimulación de la elongación transcripcional por la proteína de bromodominio Brd4.  (Inglés)  // Célula molecular. - 2005. - vol. 19, núm. 4 . - Pág. 535-545. -doi : 10.1016/ j.molcel.2005.06.029 . — PMID 16109377 .
  9. Devaiah BN , Lewis BA , Cherman N. , Hewitt MC , Albrecht BK , Robey PG , Ozato K. , Sims RJ 3rd , Singer DS BRD4 es una quinasa atípica que fosforila la serina2 del dominio carboxi-terminal de la ARN polimerasa II.  (inglés)  // Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. - 2012. - vol. 109, núm. 18 _ - Pág. 6927-6932. -doi : 10.1073/ pnas.1120422109 . — PMID 22509028 .
  10. Zhu H. , Bengsch F. , Svoronos N. , Rutkowski MR , Bitler BG , Allegrezza MJ , Yokoyama Y. , Kossenkov AV , Bradner JE , Conejo-Garcia JR , Zhang R. BET La inhibición del bromodominio promueve la inmunidad antitumoral al suprimir Expresión de PD-L1.  (Inglés)  // Informes de celdas. - 2016. - Vol. 16, núm. 11 _ - Pág. 2829-2837. -doi : 10.1016/ j.celrep.2016.08.032 . — PMID 27626654 .
  11. Hogg SJ , Vervoort SJ , Deswal S. , Ott CJ , Li J. , Cluse LA , Beavis PA , Darcy PK , Martin BP , Spencer A. , ​​Traunbauer AK , Sadovnik I. , Bauer K. , Valent P. , Bradner JE , Zuber J. , Shortt J. , Johnstone RW Los inhibidores de bromodominio BET activan el sistema inmunitario del huésped y regulan la expresión del ligando del punto de control inmunitario PD-L1.  (Inglés)  // Informes de celdas. - 2017. - Vol. 18, núm. 9 _ - Pág. 2162-2174. -doi : 10.1016/ j.celrep.2017.02.011 . — PMID 28249162 .
  12. French CA , Miyoshi I. , Aster JC , Kubonishi I. , Kroll TG , Dal Cin P. , Vargas SO , Perez-Atayde AR , Fletcher JA BRD4 reordenamiento del gen bromodomain en carcinoma agresivo con translocación t(15;19).  (Inglés)  // La revista americana de patología. - 2001. - vol. 159, núm. 6 _ - Pág. 1987-1992. - doi : 10.1016/S0002-9440(10)63049-0 . —PMID 11733348 .
  13. French CA , Miyoshi I. , Kubonishi I. , Grier HE , Perez-Atayde AR , Fletcher JA Oncogén de fusión BRD4-NUT: un mecanismo novedoso en el carcinoma agresivo.  (Inglés)  // Investigación del cáncer. - 2003. - vol. 63, núm. 2 . - Pág. 304-307. — PMID 12543779 .
  14. ^ Francés CA Patogénesis del carcinoma de línea media NUT.  (Inglés)  // Revisión anual de patología. - 2012. - vol. 7.- Pág. 247-265. -doi : 10.1146 / annurev-pathol-011811-132438 . —PMID 22017582 .