Wakhan es un principado semiindependiente en el Pamir que existió hasta 1889.
La historia del principado de Wakhan se remonta a los tiempos antiguos de la dinastía Kushan (50 a. C. - 225 d. C.), que gobernó el Pamir a través de príncipes locales semiindependientes. Y en el futuro, Wakhan pudo mantener una cierta independencia bajo el protectorado de los sasánidas (224-651), los heftalitas ( 440-670 ) , el kanato turco (551-744), el Tíbet (618-842), los chinos la dinastía Tang (861-907), Samanids (819-999), y luego la dinastía túrquico-mongola de Asia Central.
A fines de la década de 1750, el ejército chino Qing conquistó Wakhan, pero después de un breve conflicto con el Kanato de Kokand , transfirió el control de la región a este Kanato, que en 1830 gravaba a la población local.
El gobernante hereditario del principado, Mir , vivía en el pueblo de Kalai-Pyanj ("Castillo de Pyanj") o simplemente Pyanzh, ubicado en la margen izquierda del río Pyanj . Los Mirs eran Wakhans , Ismailis . Gobernaron sobre cuatro distritos de Wakhan, llamados sadada (traducido como "cien", según el número de familias que viven): Sada-i Pyanja (Spinj o Spanishj), Sada-i Khandud, Sada-i Ishtrakh (Ishtrag) y Sada-i Sarkhad (o Sarig Chupan y Pamir).
Uno de los mundos reinantes más largos de Wakhan en el siglo XIX fue Fath Ali Shah. Al principio, fue patrocinado por los gobernantes de Badakhshan Mirza Kalan, Yari Bek y Sulaiman Shah. Pero Fath Ali Shah no pudo enmendar las relaciones con Zamanuddin, el hijo de Mirza Kalan, también conocido como Mir Shah, quien reemplazó a Fath Ali al frente del Wakhan con su yerno Shah Mir Bek, quien resultó ser un gobernante despótico que vendió a muchos Wakhans como esclavos fuera de Wakhan. Sin embargo, pronto fue derrocado por el nuevo mundo de Badakhshan, Jahandar Shah (también conocido como Ghulam), quien ascendió al trono en 1864. Jahandar Shah envió una carta a Fath Ali Shah instándolo a regresar a Wakhan, y Fath Ali Shah, con la ayuda de sus compañeros, expulsó a Shah Mir de Wakhan.
En 1865, Jahandar Shah ordenó a Faz Ali Shah que ayudara a Yaqub Beg en su lucha contra los chinos, y el ejército de Wakhan dirigido por Fath Ali Shah participó en el bloqueo de Kashgar .
En 1869, Jahandar Shah fue derrocado por su medio tío Mahmud Shah, gobernante de Balkh . Durante el reinado de Mahmud Shah en Badakhshan, Fath Ali Shah rindió homenaje a este gobernante afgano de Balkh y Badakhshan. En 1873, Faizabad visitó Fayzabad para rendir tributo al vicegobernador afgano, Hafizullah Khan, y por primera vez el tributo no incluía esclavos (los esclavos eran un tipo de tributo para los gobernantes de las regiones montañosas pobres).
Fath Ali Shah murió en 1875 y su hijo Ali Mardan Shah se convirtió en el gobernante de Wakhan.
En 1880, el emir afgano Abdur-Rahman emitió un decreto sobre la abolición del principado de Wakhan.
En 1883, la expedición rusa de Dmitry Putyata visitó Wakhan . Cuando los afganos se enteraron de esto, invadieron Wakhan y Ali Mardan Shah se vio obligado a huir.
En 1888-89, una serie de levantamientos contra el nuevo régimen afgano tuvo lugar en Badakhshan, los afganos huyeron y Ali Mardan Shah volvió a ser el gobernante de Wakhan. Pero el trono de Ali Mardan pronto fue desafiado por el hakim de Ishtrag Sada (uno de los distritos de Wakhan) Ashur Khan Vahi, que colaboró con los afganos. Expulsó nuevamente a Ali Mardan, obligándolo a huir a Chitral . Ali Mardan se convirtió en el gobernador del valle de Ishkoman , donde huyeron muchos wakhianos.
Después de las expediciones de Pamir del destacamento Ionov en 1891-1894, se concluyó el acuerdo anglo-ruso de 1895 , que dividió Wakhan entre Afganistán y el Emirato de Bukhara .