Deinococcus-Thermus

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Deinococcus-Thermus

Deinococcus radiodurans , miembro del orden Deinococcales
clasificación cientifica
Dominio:bacteriasTipo de:Deinococcus-Thermus
nombre científico internacional
Deinococcus-Thermus
Sinónimos
  • Deinococcaeota Oren et al. 2015 [1]
Taxones hijos
  • clase de deinococos
    • Orden Deinococcales
    • orden de térmicas

Deinococcus-Thermus  (lat.)  - una pequeña división de bacterias , cuya única clase , Deinococci , incluye dos órdenes : Deinococcales , que incluye uno de los organismos más radiorresistentes del mundo , Deinococcus radiodurans , y Thermales , que incluye Thermus aquaticus , conocida por su polimerasa Taq , utilizada en PCR , y otras enzimas termoestables.

El departamento recibió su nombre de los géneros tipo Deinococcus y Thermus [2] .

Cavalier- Smith llama a este departamento Hadobacteria Cavalier-Smith 2002 (de la palabra Hades  - el inframundo griego ) [3] .

Descripción

Todos los representantes del departamento Deinococcus-Thermus tienen una pared celular característica de todas las bacterias gramnegativas (aunque los representantes del género Deinococcus se tiñen positivamente según el método de Gram ) [4] . Los miembros del orden Deinococcales carecen de lipopolisacáridos en su membrana externa ; acumulan carotenoides , que dan a las células su color rojo. El genoma está representado por dos cromosomas multicopia . Los Thermales sin cáscara tienen una capa S y también acumulan carotenoides, por lo que sus células suelen ser rojas o amarillas [5] .

Los representantes del filo Deinococcus-Thermus son aerobios y quimioorganoheterótrofos , que se encuentran en todas partes (los representantes del orden Thermales se encuentran en aguas termales). El análisis filogenético ha demostrado que la división Deinococcus-Thermus es uno de los grupos bacterianos más arcaicos [6] .

La base para la creación del taxón fue la proximidad de las secuencias del gen 16S rRNA [ 7] , además, una comparación de los genomas de Deinococcus radiodurans y Thermus aquaticus también muestra un cierto nivel de homología . Aparentemente, ambos grupos de bacterias en el curso de la evolución siguieron el mismo camino para adquirir resistencia a las altas temperaturas [8] [9] . Sin embargo, cabe señalar que, a diferencia de Deinococcus , los miembros del género Thermus no tienen una mayor resistencia a la radiación [5] . Lo más probable es que la termofilia de Thermales se deba a formas específicas de ARN polimerasa dependiente de ADN y ADN topoisomerasa I [10] , mientras que la radiorresistencia de Deinococcus se debe a formas específicas de excinucleasa ABC, ADN girasa y la proteína RadA implicada en la reparación del ADN [11] .

Filogenia

El árbol filogenético del filo Deinococcus-Thermus , reconstruido en base a las secuencias de ARNr 16S , es el siguiente [12] .

Notas

  1. ↑ Deinococcus-Thermus  en el sitio web del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI)  . (Consultado: 13 de diciembre de 2018) .
  2. ↑ Pinevich, 2006 , pág. 100.
  3. ↑ Cavalier-Smith T. Arraigar el árbol de la vida mediante análisis de transición.  (Inglés)  // Biología directa. - 2006. - vol. 1. - Pág. 19. - doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . —PMID 16834776 .
  4. ↑ Battista JR Contra viento y marea: las estrategias de supervivencia de Deinococcus radiodurans.  (inglés)  // Revisión anual de microbiología. - 1997. - vol. 51 . - pág. 203-224 . -doi : 10.1146 / annurev.micro.51.1.203 . — PMID 9343349 .
  5. ↑ 1 2 Pinevich, 2006 , pág. 101.
  6. ↑ Pinevich, 2006 , pág. 100-101.
  7. ↑ Weisburg WG , Giovannoni SJ , Woese CR El filo Deinococcus-Thermus y el efecto de la composición del ARNr en la construcción del árbol filogenético.  (Inglés)  // Microbiología Sistemática Y Aplicada. - 1989. - vol. 11 _ - pág. 128-134 . — PMID 11542160 .
  8. ↑ Omelchenko MV , Wolf YI , Gaidamakova EK , Matrosova VY , Vasilenko A. , Zhai M. , Daly MJ , Koonin EV , Makarova KS Genómica comparativa de Thermus thermophilus y Deinococcus radiodurans: rutas divergentes de adaptación a la termofilia y la resistencia a la radiación.  (Inglés)  // BMC biología evolutiva. - 2005. - vol. 5. - Pág. 57. - doi : 10.1186/1471-2148-5-57 . — PMID 16242020 .
  9. ↑ Makarova KS , Aravind L. , Wolf YI , Tatusov RL , Minton KW , Koonin EV , Daly MJ Genoma de la bacteria extremadamente resistente a la radiación Deinococcus radiodurans visto desde la perspectiva de la genómica comparativa.  (Inglés)  // Revisiones de microbiología y biología molecular: MMBR. - 2001. - vol. 65, núm. 1 . - Pág. 44-79. -doi : 10.1128/ MMBR.65.1.44-79.2001 . —PMID 11238985 .
  10. ↑ Zhang G. , Campbell EA , Minakhin L. , Richter C. , Severinov K. , Darst SA Estructura cristalina de la polimerasa de ARN central de Thermus aquaticus con una resolución de 3,3 A.  (Inglés)  // Celular. - 1999. - 17 de septiembre ( vol. 98 , núm. 6 ). - Pág. 811-824 . — PMID 10499798 .
  11. ↑ Tanaka M. , Earl AM , Howell HA , Park MJ , Eisen JA , Peterson SN , Battista JR El análisis de la respuesta transcripcional de Deinococcus radiodurans a la radiación ionizante y la desecación revela nuevas proteínas que contribuyen a la radiorresistencia extrema.  (Inglés)  // Genética. - 2004. - Septiembre ( vol. 168 , n. 1 ). - P. 21-33 . -doi : 10.1534/ genética.104.029249 . — PMID 15454524 .
  12. ↑ 16S rRNA-based LTP release 123 (árbol completo) . Base de datos integral de ARN ribosómico Silva. Consultado el 20 de marzo de 2016. Archivado desde el original el 16 de septiembre de 2016.

Literatura

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Taxonomía