Termococcáceas

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termococcáceas
Thermococcus gammatolerans
clasificación cientifica
Dominio:arqueasTipo de:euriarqueotesClase:Termococos Zillig y Reysenbach 2002Ordenar:Termococales Zillig 1988Familia:termococcáceas
nombre científico internacional
Thermococcaceae Zillig 1988
tipo género
Termococo Zillig 1983
Sistemática en Wikiespecies Imágenes en Wikimedia Commons ES   951477 NCBI   2259 EOL   7929

Thermococcaceae  (lat.) ( Termococci ) es una familia dearqueas del tipo Euryarchaeota , la únicaen el orden Thermococcales y la clase Thermococci [1] [2] (sinónimo de Protoarchaea Cavalier-Smith 2002 [3] ). La familia incluye 3 géneros, más de 40 especies conocidas, lo que la convierte en la familia más numerosa en el dominio de las arqueas. Probablemente, sólo se ha estudiado una pequeña parte de las especies de esta clase existentes en la naturaleza [4] .

Descripción

Se caracterizan por una temperatura muy alta de crecimiento óptimo (80 °C por encima) a un pH cercano al neutro (el óptimo para la mayoría se encuentra en el rango de 6-8) y una salinidad cercana a la del agua de mar. Los hábitats más comunes son los respiraderos hidrotermales submarinos. También se han encontrado representantes del género Thermococcus en hidrotermias terrestres en Nueva Zelanda. Actualmente no hay información sobre la presencia de termococos en ecosistemas aeróbicos y de baja temperatura y en ambientes con pH alto o bajo [4] .

Clasificación

A junio de 2017, la familia incluye los siguientes taxones [1] [5] :

• El género Palaeococcus Takai et al. 2000 [6]
  • Palaeococcus ferrophilus Takai et al. 2000 ( especie tipo )
  • Palaeococcus helgesonii Amend et al. 2006
  • Palaeococcus pacificus Zeng et al. 2013
• Género Pyrococcus Fiala y Stetter 1986 [7]
  • Pyrococcus abyssi Erauso et al. 1993 - ausente de LPSN
  • Pyrococcus esfuerzoi - ausente de LPSN
  • Pyrococcus furiosus Fiala y Stetter 1986 (especie tipo)
  • Pyrococcus glucovorans Barbier et al. 1999
  • Pyrococcus horikoshii González et al. 1999
  • Pyrococcus kukulkanii Callac et al. 2016
  • Pyrococcus woesei Zillig 1988
  • Pyrococcus yayanosii Birrien et al. 2011
• Género Thermococcus Zillig 1983 [8]
  • Thermococcus acidaminovorans Dirmeier et al. 2001
  • Thermococcus aegaeus corrig. Árabe et al. 2000
  • Thermococcus aggregans Canganella et al. 1998
  • Thermococcus alcaliphilus Keller et al. 1997
  • Thermococcus atlanticus Cambon-Bonavita et al. 2004
  • Thermococcus barophilus Marteinsson et al. 1999
  • Thermococcus barossii Duffaud et al. 2005
  • Thermococcus celer Zillig 1983 (especie tipo)
  • Thermococcus celericrescens Kuwabara et al. 2007
  • Thermococcus chitonophagus Huber y Stetter 1996
  • Thermococcus cleftensis Hensley et al. 2014
  • Thermococcus coalescens Kuwabara et al. 2005
  • Thermococcus eurythermalis Zhao et al. 2015
  • Thermococcus fumicolans Godfroy y Meunier 1996
  • Thermococcus gammatolerans Jolivet et al. 2003
  • Thermococcus gorgonarius Miroshnichenko et al. 1998
  • Thermococcus guaymasensis Canganella et al. 1998
  • Thermococcus hydrothermalis Godfroy et al. 1997
  • Thermococcus kodakarensis corrig. Atomi et al. 2005
  • Thermococcus litoralis Neuner et al. 2001
  • Thermococcus marinus - ausente de LPSN
  • Thermococcus mexicalis - ausente de LPSN
  • Thermococcus nautili Gorlas et al. 2014
  • Thermococcus onnurineus Bae et al. 2006 - ausente de LPSN
  • Thermococcus pacificus Miroshnichenko et al. 1998
  • Thermococcus paralvinellae Hensley et al. 2014
  • Thermococcus peptonophilus González et al. 1996
  • Thermococcus piezophilus Dalmasso et al. 2016 - no en LPSN
  • Thermococcus prieurii Gorlas et al. 2013
  • Thermococcus profundus Kobayashi y Horikoshi 1995
  • Thermococcus radiotolerans - ausente de LPSN
  • Thermococcus sibiricus Miroshnichenko et al. 2001
  • Thermococcus siculi Grote et al. 2000
  • Thermococcus stetteri Miroshnichenko 1990
  • Thermococcus thioreducens Pikuta et al. 2007
  • Thermococcus waimanguensis - ausente de LPSN
  • Thermococcus waiotapuensis González et al. 2001
  • Thermococcus zilligii Ronimus et al. 1999

paleococo   P. ferrophilus Takai et al. 2000 (tipo sp.)     P. helgesonii Amend et al. 2006         ? Thermococcus litoralis Neuner et al. 2001     ? Thermococcus marinus ♠ Jolivet et al. 2004     ? Thermococcus mexicalis ♠ Antoine 1996     ? Thermococcus nautilus ♠ Soler et al. 2007     ? Thermococcus onnurineus ♠ Bae et al. 2006     ? Thermococcus radiotolerans ♠ Jolivet et al. 2004     ? Thermococcus waimanguensis ♠ Goetz & Morgan 1999       Thermococcus aegaeus Arab et al. 2000       Thermococcus alcaliphilus Keller et al. 1997     Thermococcus sibiricus Miroshnichenko et al. 2001           Thermococcus aggregans Canganella et al. 1998       Thermococcus barophilus Marteinsson et al. 1999       pirococo   ? P. abyssi ♠ Erauso et al. 1993     ? P. woesei ♦ Zillig 1988     ? P. yayanosii Birrien et al. 2011       Thermococcus chitonophagus Huber y Stetter 1996     P. glucovorans Barbier et al. 1999         P. furiosus Fiala y Stetter 1986 (tipo sp.)     P. horikoshii González et al. 1999         termococo   T. gorgonarius Miroshnichenko et al. 1998     T. guaymasensis Canganella et al. 1998           T. fumicolans Godfroy y Meunier 1996     T. gammatolerans Jolivet et al. 2003         T. stetteri Miroshnichenko 1990       T. kodakarensis Atomi et al. 2005     T. peptonophilus González et al. 1996               T. profundus Kobayashi y Horikoshi 1995       T. acidaminovorans Dirmeier et al. 2001       T. pacificus Miroshnichenko et al. 1998       T. waiotapuensis González et al. 2001     T. zilligii Ronimus et al. 1999                 T. atlanticus Cambon-Bonavita et al. 2004       T. celericrescens Kuwabara et al. 2007     T. siculi Grote et al. 2000           T. coalescens Kuwabara et al. 2005     T. thioreducens Pikuta et al. 2007       T. hydrothermalis Godfroy et al. 1997     T. celer Zillig 1983 (tipo sp.)     T. barossii Duffaud et al. 2005

Notas

1. ↑ 1 2 Clasificación de dominios y phyla - Clasificación jerárquica de procariotas (bacterias) : Versión 2.0  : [ ing. ]  // LPSN. - 2016. - 2 de octubre.
2. ↑ Navegador de taxonomías: Thermococci  : [ ing. ]  // NCBI.  (Consulta: 23 de julio de 2017) .
3. ↑ Clase Protoarchaea  : [ ing. ]  // LPSN.  (Consulta: 23 de julio de 2017) .
4. ↑ 1 2 Slobodkina G. B. Detección molecular de representantes de arqueas hipertermófilas y caracterización de polimerasa de ADN termoestable de arqueas Archivado el 9 de mayo de 2012.  : disertación ... candidato de ciencias biológicas: 03.00.07. - M. , 2005. - 118 p. : enfermo. — RSL DE.
5. ↑ Navegador de taxonomías: Thermococcaceae  : [ ing. ]  // NCBI.  (Consulta: 23 de julio de 2017) .
6. ↑ Género Palaeococcus  : [ ing. ]  // LPSN.  (Consulta: 23 de julio de 2017) .
7. ↑ Género Pyrococcus  : [ ing. ]  // LPSN.  (Consulta: 23 de julio de 2017) .
8. ↑ Género Thermococcus  : [ ing. ]  // LPSN.  (Consulta: 23 de julio de 2017) .

Literatura

• Cavalier-Smith T. El origen neomuriano de las arqueobacterias, la raíz negibacteriana del árbol universal y la megaclasificación bacteriana  (inglés)  // Int. Sistema J. Evol. microbiol : diario. - 2002. - vol. 52 , núm. punto 1 - Pág. 7-76 . —PMID 11837318 .  (enlace no disponible)
• Woese CR, Kandler O., Wheelis ML Hacia un sistema natural de organismos: propuesta para los dominios Archaea, Bacteria y Eucarya  (inglés)  // Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América  : revista. - 1990. - vol. 87 , núm. 12 _ - Pág. 4576-4579 . -doi : 10.1073/ pnas.87.12.4576 . - . —PMID 2112744 .
• Zillig W., Reysenbach AL Clase IV (sic) [V]. Clase de termococos. nov. // Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volumen 1: Las arqueas y las bacterias fototróficas y profundamente ramificadas  (inglés) / DR Boone y RW Castenholz, eds. — 2do. - Nueva York: Springer Verlag , 2001. - Pág. 169. - ISBN 978-0387987712 .
• Atomi H., Fukui T., Kanai T., Morikawa M. e Imanaka T. 2004. Descripción de Thermococcus kodakaraensis sp. nov., una arquea hipertermófila bien estudiada previamente reportada como Pyrococcus sp. KOD1 . Archaea 1 : 263-267.
• Fukuda W., Ismail YS, Fukui T., Atomi H. e Imanaka T. 2005. Caracterización de una enzima málica archaeal del archaeon hipertermofílico Thermococcus kodakaraensis KOD1 . Archaea 1 : 293-301.
• Fukui T., Atomi H., Kanai T., Matsumi R., Fujiwara S. e Imanaka T. 2005. Secuencia completa del genoma de la archaeon hipertermófila Thermococcus kodakaraensis KOD1 y comparación con los genomas de Pyrococcus . Genoma Research 15 : 352-363.
• Jolivet E., L'Haridon S., Corre E., Forterre P., Prieur D. 2003. Thermococcus gammatolerans sp. nov., un archaeon hipertermofílico de un respiradero hidrotermal de aguas profundas que resiste la radiación ionizante . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva 53 : 847-851.
• Miroshnichenko ML, Gongadze GM, Rainey FA, ​​​​Kostyukova AS, Lysenko AM, Chernyh NA y Bonch-Osmolovskaya EA 1998. Thermococcus gorgonarius sp. nov. y Thermococcus pacificus sp. nov.: arqueas heterótrofas extremadamente termófilas de los respiraderos calientes submarinos de Nueva Zelanda . Revista Internacional de Bacteriología Sistemática 48 : 23-29.

Enlaces

• Referencias sobre arqueas hipertermófilas .

Clasificación arqueológica
Euryarchaeota	Archaeoglobi Hadesarchaea halobacterias metanobacterias metanococos Metanomicrobia Metanonatronarqueia Metanopiri teionarcaea termococos Termoplasmata
TACK	Aigachaeota Batiarqueota Crenarchaeota geoarqueota Korarchaeota Thaumarchaeota Verstraearchaeota
Asgard	Heimdallarchaeota Lokiarchaeota Odinarchaeota toraqueota
DPANN	Aenigmarchaeota diaferotritos micraarqueota Nanoarqueota nanohaloarqueota Pacarchaeota Parvarchaeota Undinarchaeota Woesearchaeota
Ver también: procariotas Neomura