Thaumarchaeota

Thaumarchaeota
clasificación cientifica
Dominio:arqueasTipo de:Thaumarchaeota
nombre científico internacional
Thaumarchaeota Brochier-Armanet et al. 2008
Sinónimos
Aigarchaeota Nunoura et al. 2011 [1] Nitrososphaeraeota Oren et al. 2015 [1]
Sistemática en Wikiespecies Búsqueda de imágenes en Wikimedia Commons ES   951425 NCBI   651137 EOL   10594366

Thaumarchaeota ( latín , del griego thaumas  - milagro) es un tipo de arquea que contiene solo 3 especies cultivadas y unas 20 candidatas (Candidatus). Todos los representantes actualmente descubiertos son quimiolitotrofos y oxidan amoníaco . Pueden jugar un papel importante en el ciclo bioquímico, en particular el ciclo del nitrógeno .

Historia del estudio

El filo se aisló en 2008 basándose en datos filogenéticos como las secuencias del gen rRNA de estos organismos , así como su producción de topoisomerasa tipo I , que anteriormente se pensaba que era exclusiva de los eucariotas [2] [3] . Estos supuestos fueron confirmados por análisis adicionales, cuyos resultados se publicaron en 2010. Probaron los genomas de las arqueas oxidantes de amoníaco Nitrosopumilus maritimus y Candidatus Nitrososphaera gargensis . Con base en los resultados de estos estudios, se encontró que estas dos especies tenían un origen separado junto con otra especie, Cenarchaeum symbiosum , que fue la primera especie descrita de Thaumarchaeota [4] .

Clasificación

La clasificación actual se basa en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). Si a partir de julio de 2017 en la primera fuente el tipo está representado por la única especie Nitrososphaera viennensis [5] de la clase Nitrososphaeria [6] , entonces la segunda incluye una mayor cantidad de taxones que van de especie a orden, la mayoría de los cuales son candidatos. La siguiente clasificación muestra todos los taxones hasta el género inclusive y todas las especies cultivadas [7] , con taxones cuyos representantes se conocen en cultivo puro clasificados en primer lugar:

• Clase Nitrososphaeria Stieglmeier et al. 2014
  • El orden Nitrososphaerales Stieglmeier et al. 2014
    • La familia Nitrososphaeraceae Stieglmeier et al. 2014
      • El género Nitrososphaera Stieglmeier et al. 2014
        • Nitrososphaera viennensis Stieglmeier et al. 2014 [8] y 2 candidatos más
      • El género Candidatus Nitrosocosmicus  Lehtovirta-Morley et al. 2016 (3 candidatos)
  • El orden Candidatus Nitrosocaldales  Qin et al. 2017
    • Familia Candidatus Nitrosocaldaceae  Qin et al. 2016
      • El género Candidatus Nitrosocaldus  de la Torre et al. 2008 (1 candidato)
• Órdenes incertae sedis
  • Orden Cenarchaeales DeLong y Preston 1996 - clasificado como Crenarchaeota en LPSN
    • Familia Cenarchaeaceae DeLong y Preston 1996
      • Género Cenarchaeum DeLong y Preston 1996
        • Cenarchaeum symbiosum DeLong y Preston 1996
  • El orden Nitrosopumilales Konneke et al. 2005
    • Familia Nitrosopumilaceae Konneke et al. 2005
      • El género Nitrosopumilus Konneke et al. 2005
        • Nitrosopumilus maritimus Konneke et al. 2006 y 5 candidatos más
      • El género Candidatus Nitrosoarchaeum  Blainey et al. 2011 (2 candidatos)
      • Género Candidatus Nitrosomarinus (1 candidato)
  • géneros incertae sedis
    • El género Candidatus Caldiarchaeum  Nunoura et al. 2011 (1 candidato)
    • El género Candidatus Giganthauma  Muller et al. 2010 (2 candidatos)
    • El género Candidatus Nitrosopelagicus  Santoro et al. 2014 (1 candidato)
    • El género Candidatus Nitrosotalea  Lehtovirta et al. 2011 (1 candidato)
    • El género Candidatus Nitrosotenuis  Li et al. 2016 (2 candidatos)

Notas

1. ↑ 1 2 Thaumarchaeota  (inglés) en el sitio web del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). (Consulta: 5 de agosto de 2017) .
2. ↑ Brochier-Armanet C., Boussau B., Gribaldo S., Forterre P. Mesophilic crenarchaeota: Propuesta para un tercer filo arqueal, Thaumarchaeota  // Nature Reviews Microbiology  : revista  . - 2008. - Vol. 6 , núm. 3 . - Pág. 245-252 . -doi : 10.1038 / nrmicro1852 . — PMID 18274537 .
3. ↑ Brochier-Armanet C., Gribaldo S., Forterre P. Una ADN topoisomerasa IB en Thaumarchaeota testifica la presencia de esta enzima en el último ancestro común de Archaea y Eucarya   // Biology Direct : diario. - 2008. - Vol. 3 . — Pág. 54 . -doi : 10.1186/ 1745-6150-3-54 . —PMID 19105819 .
4. ↑ Spang A., Hatzenpichler R., Brochier-Armanet C., Rattei T.,. Conjunto de genes distintos en dos linajes diferentes de arqueas oxidantes de amoníaco respaldan el filo Thaumarchaeota  //  Tendencias en microbiología : diario. - Prensa celular , 2010. - Vol. 18 , núm. 8 _ - P. 331-340 . -doi : 10.1016/ j.tim.2010.06.003 . —PMID 20598889 .
5. ↑ Género Nitrososphaera  : [ ing. ]  // LPSN.  (Consulta: 5 de agosto de 2017) .
6. ↑ Clasificación de dominios y phyla - Clasificación jerárquica de procariotas (bacterias) : Versión 2.0  : [ ing. ]  // LPSN. - 2016. - 2 de octubre.
7. ↑ Navegador de taxonomías: Thaumarchaeota  : [ ing. ]  // NCBI.  (Consulta: 5 de agosto de 2017) .
8. ↑ Tourna M., Stieglmeier M., Spang A., Könneke M., Schintlmeister A., ​​​​Urich T., Engel M., Schloter M., Wagner M. Nitrososphaera viennensis, an ammonia oxidizing archaeon from soil  (inglés)  // Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América  : revista. - 2011. - vol. 108 , núm. 20 _ - Pág. 8420-8425 . -doi : 10.1073/ pnas.1013488108 . — PMID 21525411 .