Verrucomicrobia
| Verrucomicrobia | ||||||||||
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| clasificación cientifica | ||||||||||
| Dominio:bacteriasTipo de:Verrucomicrobia | ||||||||||
| nombre científico internacional | ||||||||||
| Verrucomicrobia Hedlund 1997 [1] | ||||||||||
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Verrucomicrobia ( lat. , de lat. verruca - tubérculo) - un tipo de bacteria , que incluye principalmente formas no cultivadas. Según los datos metagenómicos , están muy extendidos en la naturaleza. Constituyen del 1 al 10% de la microbiota del suelo y por lo tanto son de gran importancia ecológica [2] .
Descripción
Los representantes de Verrucomicrobia son bacterias gramnegativas , muchas de las cuales tienen prótesis (tubérculos) en la superficie, por lo que el tipo obtuvo su nombre. Las células tienen forma de varilla, ovoides, individuales o en pares, en forma de huso. Prosthecobacter tiene una protuberancia bulbosa única en un extremo de la célula. Por tipo de nutrición, Verrucomicrobia son quimioorganoheterótrofos y fermentan una variedad de azúcares [3] . Algunos representantes pueden oxidar el metano a valores de pH extremadamente bajos [4] [5] .
Entre los Verrucomicrobia se encuentran los anaerobios , los anaerobios facultativos y los aerobios ; Los representantes del filo crecen mejor a una temperatura de 25 °C y un pH de 4 a 7. Además de los suelos, se encuentran en cuerpos de agua de agua dulce, suelos pelágicos y el tracto gastrointestinal humano [3] .
Sistemática
Según el análisis filogenético , los parientes más cercanos de Verrumicrobia son representantes del phylum Chlamydiae [6] . En 2008, se secuenció y publicó el genoma de uno de los miembros del phylum, Methylacidiphilum infernorum . Su análisis indicó una posible relación entre Verrumicrobia y Proteobacteria [7] .
Filogenia
A continuación se muestra un árbol filogenético de Verrumicrobia construido a partir de secuencias de ARNr 16S como parte del proyecto The All-Species Living Tree .
| Verrumicrobia |
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Clasificación
A diciembre de 2017, el filo incluye los siguientes taxones hasta el género [8] incluido :
- Clase " Espartobacteria "
- géneros incertae sedis
- Género Terrimicrobium
- Clase Opitutae Choo et al. 2007
- El orden Opitutales Choo et al. 2007
- Familia Opitutaceae Choo et al. 2007
- Géneros Alterococcus , Opitutus
- Familia Opitutaceae Choo et al. 2007
- El orden Puniceicoccales Choo et al. 2007
- Familia Puniceicoccaceae Choo et al. 2007
- Géneros Cerasicoccus , Coraliomargarita , Pelagicoccus , Puniceicoccus
- Familia Puniceicoccaceae Choo et al. 2007
- El orden Opitutales Choo et al. 2007
- Clase Verrucomicrobiae Hedlund et al. 1998 enmienda. Yoon et al. 2008
- El orden Verrucomicrobiales Ward-Rainey et al. 1996 enmienda. Yoon et al. 2008
- Familia Akkermansiaceae Hedlund y Derrien 2012
- género Akkermansia
- Familia Rubritaleaceae Hedlund 2012
- Género Rubritalea
- La familia Verrucomicrobiaceae Ward-Rainey et al. 1996 enmienda. Takeda et al. 2008
- Géneros Brevifollis , Haloferula , Luteolibacter , Persicirhabdus , Prosthecobacter , Roseibacillus , Roseimicrobium , Verrucomicrobium
- géneros incertae sedis
- Género Limisphaera
- Familia Akkermansiaceae Hedlund y Derrien 2012
- El orden Verrucomicrobiales Ward-Rainey et al. 1996 enmienda. Yoon et al. 2008
Notas
- ↑ Hedlund BP , Gosink JJ , Staley JT Verrucomicrobia div. nov., una nueva división de la bacteria que contiene tres nuevas especies de Prosthecobacter. (Inglés) // Antonie Van Leeuwenhoek. - 1997. - julio ( vol. 72 , n. 1 ). - P. 29-38 . — PMID 9296261 .
- ↑ Pinevich, 2006 , pág. 127-128.
- ↑ 1 2 Pinevich, 2006 , pág. 128.
- ↑ Pol Arjan, Heijmans Klaas, Harhangi Harry R., Tedesco Dario, Jetten Mike SM, Op Den Camp Huub JM Metanotrofia por debajo de pH 1 por una nueva especie de Verrucomicrobia // Nature. - 2007. - vol. 450.-P.874-878. — ISSN 0028-0836 . -doi : 10.1038/ naturaleza06222 .
- ↑ Dunfield PF , Yuryev A. , Senin P. , Smirnova AV , Stott MB , Hou S. , Ly B. , Saw JH , Zhou Z. , Ren Y. , Wang J. , Mountain BW , Crowe MA , Weatherby TM , Bodelier PL , Liesack W. , Feng L. , Wang L. , Alam M. Oxidación de metano por una bacteria extremadamente acidófila del filo Verrucomicrobia. (Inglés) // Naturaleza. - 2007. - vol. 450, núm. 7171 . - Pág. 879-882. -doi : 10.1038/ naturaleza06411 . — PMID 18004300 .
- ↑ Griffiths E. , Gupta RS La filogenia y las inserciones conservadas compartidas en las proteínas proporcionan evidencia de que Verrucomicrobia son los parientes de vida libre más cercanos conocidos de las clamidias. (Inglés) // Microbiología (Reading, Inglaterra). - 2007. - Agosto ( vol. 153 , no. Pt 8 ). - Pág. 2648-2654 . -doi : 10.1099 / mic.0.2007/009118-0 . —PMID 17660429 .
- ↑ Hou S. , Makarova KS , Saw JH , Senin P. , Ly BV , Zhou Z. , Ren Y. , Wang J. , Galperin MY , Omelchenko MV , Wolf YI , Yutin N. , Koonin EV , Stott MB , Mountain BW , Crowe MA , Smirnova AV , Dunfield PF , Feng L. , Wang L. , Alam M. Secuencia completa del genoma del aislado metanótrofo extremadamente acidófilo V4, Methylacidiphilum infernorum, un representante del filo bacteriano Verrucomicrobia. (Inglés) // Biología directa. - 2008. - 1 de julio ( vol. 3 ). - Pág. 26-26 . -doi : 10.1186/ 1745-6150-3-26 . —PMID 18593465 .
- ↑ Clasificación de dominios y phyla - Clasificación jerárquica de procariotas (bacterias) : Versión 2.0 : [ ing. ] // LPSN. - 2016. - 2 de octubre.
Literatura
- Pinevich A. V. Microbiología. Biología de los procariotas: en 3 volúmenes.- San Petersburgo. : Editorial de la Universidad de San Petersburgo, 2006. - ISBN 5-288-04056-7 .