Haplogrupo L0 (ADNmt)

Haplogrupo L0
Tipo de ADNmt
Hora de aparición 188-112,2 mil litros. norte. [una]
Ubicación de aparición Sudáfrica
grupo ancestral Eva mitocondrial
Subclados L0a'b'f'k, L0d
Mutaciones de marcadores 263!, 1048, 3516A, 5442, 6185, 9042, 9347, 10589, 12007, 12720 [2]

Haplogrupo L0  , en genética de poblaciones, el haplogrupo del ADN mitocondrial humano .

El haplogrupo L0 es una de las dos ramas del ancestro común más reciente (MRCA) para un linaje materno humano común. El haplogrupo L0 consta de cinco ramas principales (L0a, L0b, L0d, L0f, L0k). Cuatro de estos se clasificaron originalmente en clados L1 como L1a, L1d, L1f y L1K.

La separación de las líneas L0 y L1′2′3 ocurrió hace 124 mil años. norte. (95% intervalo de confianza - 151-97 mil años) [3] . En 2019, los genetistas calcularon que el linaje L0 surgió dentro del paleohumedal remanente de Makgadikgadi - Okavango en el sur de África hace aproximadamente 200 mil años. norte. (95% intervalo de confianza - 240-165 mil años) [4] .

Los especímenes de Malawi tienen subclades L0k2 (hace 10000-5000 años), L0a2 (hace 7230 años), L0f (Fingira, hace 2400 años), todos del Monte Hora, L0k2 (hace 5400-4800 años BP) y L0k1 (hace 4525 años) del abrigo rocoso Chencherere II, L0d1c (hace 5290 años) y L0d1b2b (hace 5270 años) de Fingira [5] .

El haplogrupo mitocondrial L0a2a1 [6] identificó en los especímenes 2/SEII (hace 7970–7800 años) y 2/SEI (hace 7920–7690 años) de la localidad de Shum Laka en Camerún .

L0f1 fue identificado en el espécimen LUK003 de Lukenya Hill en Kenia (3500 BP , Neolítico) [7] .

L0f2b se determinó en la muestra I3706 (Baqah_MLBA, 1424-1288 a. C.) de la cueva B3 (Cueva B3) en el valle de Baq҅ah, 20 km al noroeste de Amman ( Jordania de la Edad del Bronce ), mediante la secuenciación del ADN de la parte petrosa del hueso temporal [8] .

En 2014, se identificó una sub-rama L0d2c1c [9] en un espécimen de 2330 años de Sudáfrica (St Helena Bay) .

En 2016, se identificó un haplogrupo mitocondrial L0 en una momia de la región de Tuli en el norte de Botswana (Edad del Hierro tardía ) [10] .

En 2017, tres personas de la Edad de Piedra (Ballito Bay A, Ballito Bay B y Doonside) que vivieron ca. 2 mil litros n., y un hombre de la Edad del Hierro del Castillo de Champagne, que vivió entre 448 y 282 años. n., determinó la línea L0d2 [11] .

En 2017, la muestra sudafricana I9133 de Faraoskop Rock Shelter, de 2000 años. norte. identificó el subclade L0d1b2b1b, en la muestra I9134 de Kasteelberg, 1310 años. norte. identificado subclade L0d1a1a (fechas no calibradas). El subclado L0a se identificó en un espécimen de Tanzanía de Pemba (I1048) hace 1520 años [5] .

L0a2 (lo más probable) se determinó a partir de la muestra de Kenia I8931 (White Rock Point (GrJb2), costa sur del golfo Winam del lago Victoria) de la Edad de Piedra posterior (N/A), L0a se determinó a partir de la muestra de Tanzania I13981 ( Cueva de Gishimangeda, Pastoral_Neolítico (otro), 2730–2460 BP), L0a2d determinado a partir del espécimen de Kenia I8758 (Naishi Rockshelter, Pastoral_Neolithic (otro), 2700–2370 BP), L0f2a1 determinado a partir del espécimen de Tanzania I13977 (Cueva de Gishimangeda, Pastoral_Neolítico (otro), 2000–1890 BP), L0a1d determinado a partir del espécimen de Kenia I8805 (Egerton Cave (GrJh10), Pastoral_Neolithic (Elmenteitan), 1870–1740 BP), L0f2a determinado a partir del espécimen de Kenia I8892 (Ilkek Mounds/Ilkek II (Gilgil) (GsJj66), Pastoral Edad del Hierro, 1170–980 AP), L0a1c1 se determinó a partir del espécimen I12381 de Kenia (sitio funerario del distrito de Laikipia (GoJl45), Edad del Hierro Pastoral, 650–560 AP)) [12] .

L0k1a2 se encontró en el espécimen XAR002 de Xaro (1400 AP, Edad del Hierro Temprana) en Botswana, L0d3b1 se encontró en el espécimen TAU001 de Taukome (1100 AP, Edad del Hierro Temprana) en Botswana, L0a1b1a1 se encontró en el espécimen KIN004 de Kindoki (230 años antes el presente , 1636-1800) en la República Democrática del Congo [7] .

L0a1a1 se determinó a partir de muestras del cementerio cristiano R (∼650-1000) en la isla de Kulubnarti (Kulb) en el norte de Sudán [13] .

Se ha establecido que el haplogrupo L0 se encuentra con mayor frecuencia en el África subsahariana. Alcanza su mayor frecuencia entre los pueblos Khoisan (73%) [14] , alcanzando en Namibi (!Xun) el 79%, Sudáfrica (Khwe/!Xun) el 83% y Botswana (!Xun) el 100% [15] .

En un estudio de genomas mitocondriales en el grupo Khoisan, Behar et al., en 2008, encontraron que los antiguos genomas Khoisan estaban limitados a los haplogrupos mitocondriales L0d y L0k, en su estimación de la rama mitocondrial temprana L0k, que surgió hace aproximadamente 144 000 años. que es aproximadamente 3/4 veces la aparición del pariente mitocondrial más cercano ( Eva mitocondrial ) [16] . Otras estimaciones sitúan la ramificación del linaje mitocondrial L0k entre hace 120.000 y 160.000 años [17] [18] . La divergencia de los haplogrupos L0d y L0a'b'f'k ocurrió hace ~ 119 000 (100 100–138 200) años, la divergencia de los haplogrupos L0k y L0a'b'f ocurrió hace ~ 98 700 años (de 82 300 a 115 400) años, la divergencia de L0a ocurrió hace 42 400 (33 000–52 000) años [19] .

El árbol filogenético a continuación se basa en una publicación de Van Oven y Manfred Kaiser [2] y estudios publicados posteriormente.

Notas

  1. ↑ Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Marú; Rito, Teresa; Rohl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Esteban; Mac Aulay, Vincent. Corrección para purificar la selección: un reloj molecular mitocondrial humano mejorado  // The American  Journal of Human Genetics : diario. - 2009. - Vol. 84 , núm. 6 _ - Pág. 740-759 . -doi : 10.1016/ j.ajhg.2009.05.001 . —PMID 19500773 .
  2. ↑ 1 2 Van Oven, Mannis; Káiser, Manfred. Árbol filogenético integral actualizado de la variación global del ADN mitocondrial humano  //  Mutación humana : diario. - 2009. - Vol. 30 , núm. 2 . - Pág. E386-94 . -doi : 10.1002/ humu.20921 . —PMID 18853457 .
  3. ↑ Emily HM Wong, Andrey Khrunin, Larissa Nichols, Dmitry Pushkarev, Denis Khokhrin, Dmitry Verbenko, Oleg Evgrafov, James Knowles, John Novembre, Svetlana Limborska, Anton Valouev. Reconstrucción de la historia genética de las poblaciones de Siberia y del noreste de Europa , 2015
  4. ↑ Eva KF Chan et al. Orígenes humanos en un paleohumedal del sur de África y primeras migraciones , 2019
  5. ↑ 1 2 Pontus Skoglund et al. Reconstrucción de la estructura de la población africana prehistórica Archivado el 31 de enero de 2019 en Wayback Machine , el 21 de septiembre de 2017
  6. ↑ Mark Lipson et al. Antiguos recolectores de África occidental en el contexto de la historia de la población africana Archivado el 25 de enero de 2020 en Wayback Machine , 2020
  7. ↑ 1 2 Ke Wang et al. Los genomas antiguos revelan patrones complejos de movimiento, interacción y reemplazo de la población en el África subsahariana Archivado el 12 de junio de 2020 en Wayback Machine // Science Advances, 12 de junio de 2020
  8. ↑ Lily Agranat-Tamir et al. The Genomic History of the Bronze Age Southern Levant Archivado el 8 de agosto de 2021 en Wayback Machine , el 28 de mayo de 2020 (Tabla S1. Descripción general de las 73 personas recientemente informadas en este estudio, relacionadas con la Figura 1)
  9. ↑ Alan G. Morris, Anja Heinze, Eva KF Chan, Andrew B. Smith, Vanessa M. Hayes. Primer genoma humano mitocondrial antiguo de un prepastoralista del sur de África  // Biología y evolución  del genoma : diario. - 2014. - doi : 10.1093/gbe/evu202 .
  10. ↑ Frank J. Rühli, Maryna Steyn, Morongwa N. Mosothwane, Lena Öhrström, Molebogeng K. Bodiba, Abigail Bouwman. Análisis radiológico y genético de una momia de la Edad del Hierro tardía del Tuli Block, Botswana  // South African Journal of  Science : diario. — vol. 112 , núm. 1/2 . Archivado desde el original el 21 de junio de 2016.
  11. ↑ Carina M. Schlebusch et al. Los genomas antiguos del sur de África empujan la divergencia humana moderna más allá de hace 260,000 años , 2017
  12. ↑ Mary E. Prendergast et al. El ADN antiguo revela una propagación de varios pasos de los primeros pastores en el África subsahariana Archivado el 1 de junio de 2019 en Wayback Machine (Tabla S7. (archivo separado) haplogrupos de mtDNA), 2019
  13. ↑ Kendra A. Sirak et al. Estratificación social sin diferenciación genética en el sitio de Kulubnarti en Christian Period Nubia Archivado el 6 de marzo de 2021 en Wayback Machine , 17 de febrero de 2021 ( Figura complementaria 5, 6 Archivado el 23 de octubre de 2021 en Wayback Machine )
  14. ↑ Rosa, Alejandra; Brehm, Antonio; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Williams, Ricardo. Perfil de ADNmt de los guineanos de África occidental: hacia una mejor comprensión de la región de Senegambia   // Annals of Human Genetics : diario. - 2004. - vol. 68 , núm. 4 . - Pág. 340-352 . doi : 10.1046/ j.1529-8817.2004.00100.x . — PMID 15225159 .
  15. ↑ Tishkoff, SA; Gonder, MK; Henn, BM; Mortensen, H.; Caballero, A.; Gignoux, C.; Fernandopulle, N.; Lema, G.; Nyambo, TB Historia de las poblaciones africanas que hablan con un clic deducidas de la variación genética del ADNmt y del cromosoma Y  // Biología  molecular y evolución : diario. - Prensa de la Universidad de Oxford , 2007. - Vol. 24 , núm. 10 _ - Pág. 2180-2195 . -doi : 10.1093 / molbev/msm155 . —PMID 17656633 .
  16. ↑ Behar, DM; Willems, R; Williams; Buenas a todos, H; Buenas a todos; Blue-Smith, J; herrero azul; Pereira, L; pereira; Metspalú, E; metspalú; Scozzari, R; Scozzari; La Meca, H; La Meca; Tzur, S; Tzur; D. El amanecer de la diversidad matrilineal humana  // American Journal of Human  Genetics : diario. - 2008. - mayo ( vol. 82 , n. 5 ). - P. 1130-1140 . -doi : 10.1016/ j.ajhg.2008.04.002 . — PMID 18439549 .
  17. ↑ Soares, P; Ermini, L; Ermini; Thomson, N; Thomson; Mormina, M; Mormina; Rito, T; rito; Rohl, A; Rohl; Salas, A; salas; Oppenheimer, S; Oppenheimer; Macaulay, V; MacAulay; Corrección de  MB para purificar la selección: un reloj molecular mitocondrial humano mejorado // American  Journal of Human Genetics : diario. - 2009. - junio ( vol. 84 , no. 6 ). - Pág. 740-759 . -doi : 10.1016/ j.ajhg.2009.05.001 . —PMID 19500773 .
  18. ↑ Gonder, MK; Mortensen, HM; Mortensen; Reed, F. A.; Junco; de Sousa, A; De Sousa; Tishkoff, SA; Tishkoff. Análisis de la secuencia del genoma de ADNmt completo de antiguos linajes africanos  (inglés)  // Mol. Biol. Evol: diario. - 2007. - diciembre ( vol. 24 , no. 3 ). - Pág. 757-768 . -doi : 10.1093 / molbev/msl209 . — PMID 17194802 .
  19. ↑ Daniel Shriner et al. La ascendencia genética de los pueblos hadza y sandawe revela la estructura de la población antigua en África
  20. ↑ Primer genoma humano mitocondrial antiguo de un prepastoralista del sur de África . Consultado el 9 de mayo de 2016. Archivado desde el original el 8 de octubre de 2014.
  21. ↑ Alan G. Morris et al. Primer genoma humano mitocondrial antiguo de un prepastoralista del sur de África

Véase también

Árbol de haplogrupos de ADNmt humano

Eva mitocondrial
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L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
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METRO norte
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cz D mi GRAMO q R O A S X Y N1 N2
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C Z B F R0 pre-JT PAGS Reino Unido yo N1a W
| | |
alto voltaje JT tu k
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H V j T Clústeres IWX heredados


Enlaces

Información general

Haplogrupo L3