Alfa-galactosidasa
Las melibiasas (o α-galactosidasas ) ( EC 3.2.1.22 ) son glicosil hidrolasas capaces de escindir, por regla general, conservando su configuración óptica , residuos terminales no reductores de α-D-galactosa de α-D- galactósidos , incluyendo de galactooligosacáridos , galactomananos y galactolípidos . Sus sustratos naturales más simples son el disacárido melibiosa y el trisacárido rafinosa . En varios casos, se encontró actividad transgalactosidasa en melibiasas. Las α-N-acetilgalactosaminidasa son bioquímica y evolutivamente similares a las α-galactosidasas ( EC 3.2.1.49 ).
Familias melibiasis
Según su estructura, los dominios catalíticos de todas las α-galactosidasas se han asignado a seis familias: GH4 , GH27 , GH36 , GH57 , GH97 y GH110 .
- Las familias GH27 y GH36 en un nivel jerárquico superior forman el clan GH-D. Los dominios de este clan tienen una estructura tridimensional (β/α) de ocho barriles, también conocida como barril TIM. Esta estructura tridimensional es la más común entre los dominios catalíticos de todas las glicosil hidrolasas y también una de las más comunes entre todas las proteínas. Todos los organismos multicelulares y la mayoría de los eucariotas y bacterias unicelulares estudiados poseen α-galactosidasas. Entre las arqueas, se encuentran solo en ciertas especies. La mayoría de las α-galactosidasas eucariotas pertenecen a la familia GH27, mientras que la mayoría de las α-galactosidasas bacterianas pertenecen a la familia GH36. Estas dos familias contienen casi exclusivamente α-galactosidasas y α-N-acetilgalactosaminidasa. El análisis filogenético de la familia GH36 mostró su origen polifilético, lo que permitió dividir esta familia en ocho nuevas. Estas ocho familias, junto con las familias GH27 y GH31 , forman la superfamilia de las α-galactosidasas.
- Los dominios catalíticos de la familia GH97 también tienen una estructura (β/α) de 8 barriles. En la actualidad, se ha demostrado que solo un representante de esta familia tiene actividad de α-galactosidasa, en una de las proteínas de la bacteria Bacteroides thetaiotaomicron .
- Los dominios catalíticos de la familia GH57 tienen una estructura similar al barril TIM, el barril (β/α) 7 . La familia GH57 contiene tanto las α-galactosidasas arcaicas conocidas hasta la fecha como una serie de glicosil hidrolasas procarióticas con otras actividades.
- La familia GH4 incluye glucosidasas bacterianas con una amplia especificidad de sustrato. Se demostró que tres de ellos tenían actividad de α-galactosidasa.
- La familia GH110 incluye α-galactosidasas únicas capaces de escindir los residuos de α-D-galactosa invirtiendo su configuración óptica. Estas enzimas se han encontrado en las bacterias Bacteroides fragilis , B. thetaiotaomicron y Streptomyces avermitilis .
Es probable que los genes de la α-galactosidasa de las familias GH27, GH36, GH57 y GH97 tengan un origen evolutivo común.
Muchas mutaciones en el gen de la α-galactosidasa en humanos conducen a la enfermedad de Fabry , y en el gen de la α-N-acetilgalactosaminidasa a la enfermedad de Schindler , también conocida
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Véase también