Agujero de oxianión

Un agujero de oxianión  es un bolsillo en el sitio activo de una enzima que estabiliza la carga negativa del estado de transición en el oxígeno desprotonado o alcóxido [1] . El bolsillo generalmente consiste en amidas de la columna vertebral o residuos cargados positivamente. La estabilización del estado de transición reduce la energía de activación requerida para la reacción y por lo tanto promueve la catálisis [2] . Por ejemplo, las proteasas como la quimotripsina contienen un agujero de oxianión para estabilizar el anión tetraédrico intermedio formado durante la proteólisis y proteger el oxígeno del sustrato con carga negativa de las moléculas de agua [3] . Además, un orificio de oxianión puede permitir la inserción o el posicionamiento de un sustrato que sufrirá un impedimento estérico si no logra ocupar el orificio apropiado (como BPG en la hemoglobina ). Las enzimas que catalizan reacciones de múltiples pasos pueden tener múltiples agujeros de oxianión que estabilizan diferentes estados de transición en la reacción [4] .

Véase también

Notas

  1. Jeremy M. Berg. bioquímica _ — 5ª ed. - Nueva York: WH Freeman, 2002. - 1 volumen (varias paginaciones) p. — ISBN 0-7167-3051-0 , 978-0-7167-3051-4, 0-7167-4954-8, 978-0-7167-4954-7, 0-7167-4684-0, 978-0- 7167-4684-3, 0-7167-4955-6, 978-0-7167-4955-4. Archivado el 27 de octubre de 2007 en Wayback Machine .
  2. Simón, Luis (19 de marzo de 2010). "Catálisis enzimática por enlaces de hidrógeno: el equilibrio entre la unión del estado de transición y la unión del sustrato en los agujeros de oxianión". El Diario de Química Orgánica . 75 (6): 1831-1840. DOI : 10.1021/jo901503d . ISSN  0022-3263 . PMID20039621  ._ _
  3. Ménard, Robert (1992). "Interacciones de agujeros de oxianión en serina y cisteína proteasas". Química Biológica Hoppe-Seyler . 373 (2): 393-400. DOI : 10.1515/bchm3.1992.373.2.393 . PMID  1387535 .
  4. Kursula, Petri (1 de diciembre de 2002). "El ciclo catalítico de la tiolasa biosintética: un viaje conformacional de un grupo acetilo a través de cuatro modos de unión y dos agujeros de oxianión‡". bioquímica _ 41 (52): 15543-15556. DOI : 10.1021/bi0266232 . ISSN  0006-2960 . IDPM  12501183 .

Literatura

Alberto Lehninger . Principios de Bioquímica . — 5to. - Macmillan, 2008. - Pág. 207. - ISBN 9780716771081 . Archivadoel 31 de mayo de 2021 enWayback Machine