Cedratvirus

Cedratvirus
clasificación cientifica
Grupo:Virus [2]Reino:incertae sedis [1]Familia:PithoviridaeGénero:Cedratvirus
nombre científico internacional
Cedratvirus
Tipos
  • Cedratvirus A11
  • Cedratvirus getuliensis
  • Cedratvirus lausannensis
el grupo de baltimore
I: virus dsDNA

Cedratvirus  (lat.) es un género de virus gigantes de la familia Pithoviridae , que tiene viriones en forma de huevo . Cedratvirus se diferencia de otros virus en la presencia de cubiertas de dos capas [3] .

El primer representante del género Cedratvirus A11 se describió en 2016 durante el cocultivo de amebas Acanthamoeba castellanii con varias muestras ambientales tomadas de Argelia [3] .

A noviembre de 2018, el género Cedratvirus no se encuentra registrado en la base de datos del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) [4] .

Descripción

Los viriones de Cedratvirus alcanzan una longitud de 1 a 1,2 micras y hasta 0,5 micras de diámetro . Los viriones son de forma ovoide y similares a los viriones de Pithovirus sibericum , además, tienen un tegumento de dos capas. El grosor del tegumento del virión es diferente en las diferentes etapas del ciclo infeccioso . En las primeras etapas de la infección, la capa exterior tiene un grosor de 40 ± 5 nm y luego aumenta hasta los 55 ± 5 nm. Dichos cambios pueden ser causados ​​por la internalización de partículas virales en los fagosomas y vacuolas de la ameba, así como por la destrucción gradual de los viriones después de la liberación del ADN viral en el citoplasma de la célula . Al igual que en P. sibericum , el ADN ingresa al citoplasma a través de un orificio especial en la cápside [3] .

El genoma de Cedratvirus está representado por una molécula de ADN circular de doble cadena que consta de 589.068 pares de bases (pb). La composición GC del genoma es del 42,6%. A pesar de la similitud morfológica de los viriones con los viriones de Pithovirus , el genoma de Cedratvirus es más corto que el de P. sibericum y P. massiliensis entre 21 y 97 mil pb. respectivamente. No se han identificado secuencias palindrómicas repetidas en el genoma del Cedratvirus , pero se han identificado 27 posibles regiones repetidas. Hay 574 proteínas predichas codificadas en el genoma de Cedratvirus , más que en los virus del género Pithovirus . No se encontraron genes de ARNt en el genoma. No se pudieron encontrar homólogos para 177 proteínas de Cedratvirus en las bases de datos . 258 de sus proteínas son homólogas a proteínas de otros virus, 108 a proteínas eucariotas y solo 31 a proteínas procariotas . Entre las proteínas virales, el 84,1% de los homólogos pertenecen a Pithovirus . Los homólogos de proteínas de origen eucariótico pertenecen al alga verde Micromonas pusilla , la ameba huésped A. castellanii y el alga parda Ectocarpus siliculosus . De los genes de Cedratvirus que se han anotado, muchos están involucrados en procesos exclusivos de virus gigantes: por ejemplo, se encontraron genes para la biosíntesis de aminoácidos aromáticos y el gen de la D-3-fosfoglicerato deshidrogenasa . También se identificaron dos copias del gen de la ribonucleasa III y un homólogo distante del gen de la ribonucleasa H [3] .

Ciclo de vida

El ciclo infeccioso del Cedratvirus comienza de manera estándar para los virus gigantes: los viriones son fagocitados por la ameba, ingresan a los fagosomas y luego a las vacuolas, luego de la fusión de la membrana viral interna y la membrana de la vacuola, el ADN viral ingresa al citoplasma. Aparentemente, solo una capa de la cápside bicapa está involucrada en la salida del ADN. En el citoplasma también se detecta un cierto número de partículas virales vacías que no contienen ADN. 4 horas después de la infección, aparece una fábrica de virus en el citoplasma de la célula . Al cabo de dos a cuatro horas se detectan en ellos viriones maduros, aunque no cesa la formación de nuevas partículas. 10 horas después de la infección del cultivo, algunas células se rompen, liberando partículas virales, y 24 horas después de la infección, se produce la lisis completa del cultivo [3] .

Filogenia y relaciones

Se cree que los parientes más cercanos de Cedratvirus son Pithovirus sibericum y Pithovirus massiliensis , por lo que ambos géneros se asignan tentativamente a la familia Pithoviridae [3] . En 2017, se anunció el descubrimiento de otro representante de Cedratvirus : Cedratvirus lausannensis , que también está cerca de Pithovirus . Se encontró en una muestra de agua para regar plantas en Francia [5] . En 2018, se describió otro representante del género: Cedratvirus getuliensis , que se descubrió en Brasil [6] . El análisis filogenético en 2018 mostró que el virus brasileño forma una rama evolutiva separada en el género Cedratvirus [7] .

Notas

  1. ↑ El taxón no está reconocido por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV).
  2. ↑ Taxonomy of Viruses  en el sitio web del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) .
  3. ↑ 1 2 3 4 5 6 Andreani J. , Aherfi S. , Bou Khalil JY , Di Pinto F. , Bitam I. , Raoult D. , Colson P. , La Scola B. Cedratvirus, a Double-Cork Structured Giant Virus, es un pariente lejano de los Pithovirus.  (inglés)  // Virus. - 2016. - 3 de noviembre ( vol. 8 , no. 11 ). -doi : 10.3390/ v8110300 . —PMID 27827884 .
  4. ↑ Buscar Cedratvirus en la base de datos de ICTV (enlace descendente) . Consultado el 11 de noviembre de 2018. Archivado desde el original el 4 de octubre de 2013. 
  5. ↑ Bertelli C. , Mueller L. , Thomas V. , Pillonel T. , Jacquier N. , Greub G. Cedratvirus lausannensis: profundizando en la diversidad de Pithoviridae.  (Inglés)  // Microbiología Ambiental. - 2017. - Octubre ( vol. 19 , no. 10 ). - Pág. 4022-4034 . -doi : 10.1111/ 1462-2920.13813 . — PMID 28618143 .
  6. ↑ Silva LKDS , Andrade ACDSP , Dornas FP , Rodrigues RAL , Arantes T. , Kroon EG , Bonjardim CA , Abrahão JS Ciclo de replicación de Cedratvirus getuliensis: un análisis morfológico en profundidad.  (Inglés)  // Informes científicos. - 2018. - 5 de marzo ( vol. 8 , no. 1 ). - Pág. 4000-4000 . -doi : 10.1038/ s41598-018-22398-3 . —PMID 29507337 .
  7. ↑ Rodrigues RAL , Andreani J. , Andrade ACDSP , Machado TB , Abdi S. , Levasseur A. , Abrahão JS , La Scola B. Los análisis morfológicos y genómicos de nuevos aislamientos revelan un segundo linaje de Cedratvirus.  (inglés)  // Revista de virología. - 2018. - 1 de julio ( vol. 92 , no. 13 ). -doi : 10.1128/ JVI.00372-18 . —PMID 29695424 .

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