Ligamenvirales
Los ligamenvirales son un linaje de virus que infectan alas arqueas Thermoproteota (anteriormente Crenarchaeota) y tienen genomas de ADN de doble cadena [2] . La orden fue propuesta por David Prangishvili y Mart Krupovich en 2012 y posteriormente creada por el Comité Internacional sobre Sistemática de Virus (ICTV).
El nombre proviene del latín ligamen , que significa cuerda o hilo .
Clasificación
Hay dos familias en este orden: Lipothrixviridae y Rudiviridae .
Los virones son filamentosos con una nucleocápside helicoidal . Unidos a ambos extremos hay vellosidades o estructuras más complejas involucradas en la adhesión a la célula huésped.
Las principales proteínas de la cubierta de los lipotrixvirus y los rudivirus tienen una topología inusual de haces de cuatro hélices [3] [4] [5] [6] . El genoma es un ADN de doble cadena lineal no segmentado. Los virus de estas dos familias comparten hasta diez genes. La principal diferencia entre las dos familias es que los miembros de la familia Rudiviridae no están envueltos, mientras que las nucleocápsidas de los lipothrixvirus están rodeadas por una membrana lipídica. Además, mientras que la cápside de los rudivirus se compone de una sola proteína central, la cápside de los lipotrixvirus se compone de dos proteínas centrales parálogas. En ambos grupos de virus, las principales proteínas de la cápside forman un dímero similar a una garra (homodímero en los rudivirus y heterodímero en los lipothrixvirus) que envuelve el dsDNA.
Los representantes de Ligamenvirales están estructuralmente relacionados con los virus archaeal de la familia Tristromaviridae , que, como los lipotrixvirus, codifican dos proteínas principales de la cápside parálogas con el mismo pliegue que en los ligamenvirus [7] . Debido a estas similitudes estructurales, se ha propuesto que el orden Ligamenvirales y la familia Tristromaviridae se combinen en la clase "Tokiviricetes" (toki significa "hilo" en georgiano y viricetes es el sufijo oficial para la clase de virus) [7] .
A partir de marzo de 2020, la orden incluye 2 familias y 5 géneros [8] :
- Familia Lipothrixviridae
- Género Alphalipothrixvirus
- Género Betalipothrixvirus
- Género Deltalipothrixvirus
- Género Gammalipothrixvirus
- Familia Lipothrixviridae
Los representantes del destacamento tienen hasta 10 genes comunes.
Notas
- ↑ Taxonomy of Viruses en el sitio web del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) .
- ↑ Prangishvili D ; Krupović M (2012). “Un nuevo taxón propuesto para virus de ADN de doble cadena, el orden Ligamenvirales ”. Arco Virol . 157 (4): 791-795. DOI : 10.1007/s00705-012-1229-7 . PMID22270758 . _
- ↑ Goulet A, Blangy S, Redder P, Prangishvili D, Felisberto-Rodrigues C, Forterre P, Campanacci V, Cambillau C (2009) Las proteínas de la cubierta del virus filamentoso Acidianus 1 muestran un pliegue helicoidal que abarca el linaje de los virus arqueales filamentosos. PNAS 106 (50) 21155-60
- ↑ DiMaio, F; Yu, X; Rensen, E; Krupović, M; Prangishvili, D; Egelman, EH (2015). Virología. Un virus que infecta a un hipertermófilo encapsida el ADN en forma de A” . ciencia _ 348 (6237): 914-7. doi : 10.1126/ciencia.aaa4181 . PMC 5512286 . PMID 25999507 .
- ↑ Kasson, P; Di Maio, F; Yu, X; Lucas-Staat, S; Krupović, M; Schouten, S; Prangishvili, D; Egelman, EH (2017). “Modelo para una nueva envoltura de membrana en un virus hipertermofílico filamentoso” . eLife . 6 : e26268. DOI : 10.7554/eLife.26268 . PMC 5517147 . PMID 28639939 .
- ↑ Liu, Y; Osinski, T; Wang, F.; Krupović, M; Schouten, S; Kason, P; Prangishvili, D; Egelman, EH (2018). “Conservación estructural en un virus filamentoso envuelto en membrana que infecta a un acidófilo hipertermofílico” . Comunicaciones de la Naturaleza . 9 (1): 3360. Código Bib : 2018NatCo...9.3360L . DOI : 10.1038/s41467-018-05684-6 . PMC 6105669 . PMID 30135568 .
- ↑ 12 Wang, Fengbin ; Baquero, Diana P; Su, Zhangli; Osinski, Tomasz; Prangishvili, David; Egelman, Edward H; Krupovic, Mart (2020). "La estructura de un virus filamentoso descubre lazos familiares dentro de la virosfera archaeal" . Evolución de virus . 6 (1): veaa023. DOI : 10.1093/ve/veaa023 . PMC 7189273 . PMID 32368353 .
- ↑ Taxonomy of Viruses en el sitio web del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . (Consultado: 24 de abril de 2020) .
Clasificación de virus según Baltimore |
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ADN | I: virus |
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Adnaviria | |
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Duplodnaviria | |
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Monodnaviria | |
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varidnaviria | Bamfordvirae_ | Nucleocitoviricota | Pokkesviricetes | |
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Megaviricetes | Algavirales |
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Imitervirales |
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Pimascovirales |
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Preplasmiviricota_ | |
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Helvetiavirae_ | divididoviricota_ | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae_
- Sphaerolipoviridae
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Desclasificado | naldaviricetes | lefavirales |
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Desclasificado |
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Desclasificado |
- familia : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae_
- clavaviridae_
- Fuselloviridae_
- Globuloviridae_
- Guttaviridae_
- Halspiviridae_
- Ovalivridae
- Plasmaviridae_
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae_
- Thaspiviridae_
- Géneros : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
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| II: ADN virus |
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Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota_ | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
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Sangervirae_ | |
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Shotokuvirae | Cossaviricota_ | |
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Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
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Cirlivirales |
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cremevirales |
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Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae_
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recrevirales |
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Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae_
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Trapavirae_ | |
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Desclasificado |
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ARN | | IV: (+) virus ARN |
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riboviria | Orthornavirae | kitrinoviricota_ | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alfatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae_
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Martellivirales |
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timovirales |
- Alfaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
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Flasuviricetes | |
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Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae_
- Sinhaliviridae
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Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae_
- Luteoviridae_
- Tombusviridae_
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lenarviricota_ | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae_
- Fiersviridae_
- Solspiviridae_
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Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae_
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Amabiliviricetes | |
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Howeltoviricetes | |
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miaviricetes | |
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Pisuviricota | Pisoniviricetes | nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae_
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae_
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Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae_
- Flaviridae_
- Secoviridae_
- Dicistroviridae
- Policipiviridae
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Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae_
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Stelpaviricetes | |
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Desclasificado |
- Familias : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
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DE | |
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