Secuenciador de ADN

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Un secuenciador de ADN (secuenciador) es un instrumento o dispositivo científico que determina automáticamente la secuencia de nucleótidos en una cadena de ADN  - secuenciación . Una muestra de ADN se carga en el secuenciador, el resultado de su trabajo es un conjunto de secuencias de bases de adenina , timina , guanina , citosina , generalmente almacenadas como cadenas de texto con las letras A, T, G, C (las llamadas "lee ").

Los primeros secuenciadores automatizados fueron introducidos por Applied Biosystems en 1987 y utilizaron el método Sanger . Este método es la base de la primera generación de secuenciadores. Con su ayuda, se completó en 2001 el Proyecto Genoma Humano (lectura completa del genoma humano ). Las instalaciones de la primera generación fueron la automatización de sistemas electroforéticos que determinaban la migración de fragmentos de ADN marcados en el gel, separándolos por masa (longitud).

El Proyecto Genoma Humano generó el desarrollo de sistemas de secuenciación de precisión de bajo costo y alto rendimiento llamados secuenciadores de próxima generación (NGS). Entre tales sistemas: 454, SOLiD, Illumina DNA. Dichos secuenciadores han acelerado el proceso de lectura de códigos de ADN en órdenes de magnitud en comparación con el método anterior de Sanger. La preparación de muestras de ADN para dichos dispositivos está automatizada y lleva alrededor de una hora y media. Solo se necesitan unos pocos días para leer 15 veces un genoma de tamaño humano.

Los secuenciadores más nuevos son de tercera generación (por ejemplo, SMRT y Oxford Nanopore) y funcionan mediante la medición en tiempo real de nucleótidos individuales de moléculas de ADN individuales (agregando nucleótidos o arrastrando una cadena a través de una estructura de proteína de nanoporos ).

Moderno[ ¿cuándo? ] secuenciadores[ ¿Qué? ] tienen sistemas ópticos con la ayuda de los cuales se fijan las señales - terminadores de tinte ( ing.  tinte-terminadores ) - fluorocromos que tienen diferentes longitudes de onda y, en consecuencia, color, se unen a un nucleótido específico en el ADN (verde - adenina , rojo - timina , negro - guanina , azul - citosina ).

Secuenciadores automatizados

El primer secuenciador de ADN automatizado basado en el método de Sanger fue desarrollado por L. M. Smith y comercializado por  Applied Biosystems en 1987. [una]

Véase también

Notas

  1. Robert Mullan Cook-Deegan. Orígenes del Proyecto Genoma Humano . Universidad de Washington. Consultado el 20 de octubre de 2014. Archivado desde el original el 6 de noviembre de 2020.

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