Zamilón

Zamilón

Micrografía electrónica de la fábrica de virus en una célula de ameba infectada con Zamilon y Mont1 al mismo tiempo. Las flechas apuntan a partículas Mont1 anormales. Barra de escala - 0,1 µm
clasificación cientifica
Grupo:virus [1]Reino:varidnaviriaReino:BamfordviraeTipo de:PreplasmiviricotaClase:MaveriviricetesOrdenar:priklausoviralesFamilia:virófagosGénero:SputnikvirusVista:Zamilón
nombre científico internacional
Virus Zamilon dependiente de mimivirus
Sinónimos
según NCBI [2] :
  • virófago de Zamilon
  • virus Zamilón
el grupo de baltimore
I: virus dsDNA

Zamilon [3] ( Ing.  Mimivirus-dependiente de virus Zamilon , anteriormente Zamilon virophage ) es un virófago que infecta a la ameba Acanthamoeba polyphaga . Fue aislado en 2013 en Túnez a partir de una muestra de suelo junto con el virus Mont1 . La palabra "zamilon" en la traducción de  Ar.  -  "vecino". El Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) identifica este virus como una especie separada del género Sputnikvirus de la familia Lavidaviridae [4] . En 2015, se describió en América del Norte un virófago estrechamente relacionado con Zamilon y se denominó "Zamilon 2" [5] .

Estructura y genoma

Zamilon es una partícula esférica con un diámetro de 50-60 nm y se parece a otros virófagos, a saber, Sputnik y mavirus . El genoma de Zamilon es una molécula de ADN circular de 17 276 pares de bases (pb) con un bajo contenido de GC (29,7 %), que contiene 20 marcos de lectura abiertos (ORF) que varían en longitud de 222 a 2337 pb. El genoma de Zamilon es significativamente diferente del genoma de Sputnik: tienen un 76 % de nucleótidos idénticos mientras que cubren el genoma de Sputnik en un 75 %. Sin embargo, 17 ORF de Zamilon son homólogos a los genes Sputnik , dos ORF son homólogos a los genes de Megavirus chiliensis y un ORF es homólogo a Moumouvirus monve [6] . Entre las proteínas predichas de Zamilon, fue posible identificar transposasa , helicasa , integrasa , cisteína proteasa , ADN primasa polimerasa , así como ATPasas que empaquetan el ADN en viriones , proteínas de la cápside mayor y pequeña , proteína estructural y proteína similar al colágeno . . El sexto producto ORF es muy similar a la proteína principal de la cápside Sputnik, que contiene el motivo estructural característico " plegado en rollo de gelatina " [7] [8] .

Ciclo de vida

Al igual que otros virófagos, la replicación del genoma de Zamilon se produce en el citoplasma de la célula huésped , más precisamente, en la fábrica viral del virus huésped. Inicialmente, Zamilon se aisló junto con la cepa Mont1, que forma parte de la familia Mimiviridae . Posteriormente, se demostró que cepas de Moumouvirus, Monve, Terra1 y Courdo11, también incluidas en la familia Mimiviridae , pueden actuar como virus hospedadores para Zamilon , pero no mamivirus y mimivirus [9] . En este sentido, Zamilon difiere de Sputnik, cuyo virus huésped puede ser cualquier miembro de la familia Mimiviridae [7] .

Aparentemente, Zamilon no tiene un fuerte efecto inhibitorio sobre la multiplicación del virus huésped y su capacidad para provocar la lisis de las células de ameba del huésped. Aunque el virus huésped tiene una alta proporción de viriones defectuosos en presencia de Zamilon, esto se observa a menudo en ausencia del virófago. Esto también distingue a Zamilon de Sputnik, que reduce la infectividad del virus huésped y suprime la lisis de las células infectadas [7] .

MIMIVIRE

En 2016 apareció un informe sobre el descubrimiento en mimivirus del grupo A de un mecanismo responsable de la resistencia al virófago Zamilon. El elemento clave de este mecanismo es el sistema genético MIMIvirus VIrophage Resistant Element (MIMIVIRE) que contiene varios insertos correspondientes a secuencias del genoma de Zamilon. Se ha sugerido que el sistema basado en MIMIVIRE funciona de manera similar a los sistemas CRISPR /Cas que brindan protección contra virus en bacterias y arqueas : los ARN se sintetizan a partir de insertos en el genoma de Mimivirus , que se unen de manera complementaria a los genomas de virófagos, lo que lleva a su destrucción. [10] . Esta conclusión está respaldada por datos de experimentos para desactivar MIMIVIRE. Sin embargo, esta hipótesis tiene una serie de problemas. No está claro, por ejemplo, cómo el sistema MIMIVIRE distingue insertos del genoma del virófago en el genoma del mimivirus de las mismas secuencias en el genoma del virófago y evita la destrucción del genoma del propio mimivirus. Se ha propuesto un mecanismo alternativo de funcionamiento de MIMIVIRE, que no se basa en interacciones complementarias de ácidos nucleicos , sino en interacciones proteína-proteína [11] .

Notas

  1. Taxonomy of Viruses  en el sitio web del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) .
  2. Virus Zamilon  en el sitio web del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI)  . (Consultado: 23 de diciembre de 2019) .
  3. Kirill Stasevich. Virus gigantes han encontrado un "sistema inmunológico" bacteriano  // Ciencia y Vida . — 2016.
  4. Krupovic M. , Kuhn JH , Fischer MG  Un sistema de clasificación para virófagos y virus satélite  // Archives of Virology. - 2016. - Vol. 161, núm. 1.- Pág. 233-247. -doi : 10.1007/ s00705-015-2622-9 . — PMID 26446887 .
  5. Bekliz M. , Verneau J. , Benamar S. , Raoult D. , La Scola B. , Colson P. A New Zamilon-like Virophage Partial Genome Assembled from a Bioreactor Metagenome.  (Inglés)  // Fronteras en Microbiología. - 2015. - Vol. 6 _ - P. 1308-1308 . -doi : 10.3389/ fmicb.2015.01308 . — PMID 26640459 .
  6. Bekliz M. , Colson P. , La Scola B.  La familia en expansión de virófagos  // Virus. - 2016. - Vol. 8, núm. 11. -doi : 10.3390/v8110317 . —PMID 27886075 .
  7. 1 2 3 Gaia M. , Benamar S. , Boughalmi M. , Pagnier I. , Croce O. , Colson P. , Raoult D. , La Scola B.  Zamilon, a Novel Virophage with Mimiviridae Host Specificity  // PLoS One . - 2014. - Vol. 9, núm. 4.- P. e94923. - doi : 10.1371/journal.pone.0094923 . — PMID 24747414 .
  8. Zhang X. , Sun S. , Xiang Y. , Wong J. , Klose T. , Raoult D. , Rossmann MG Estructura del Sputnik, un virófago, con una resolución de 3,5 Å.  (inglés)  // Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América. - 2012. - vol. 109, núm. 45 . - Pág. 18431-18436. -doi : 10.1073/ pnas.1211702109 . — PMID 23091035 .
  9. Aherfi S. , La Scola B. , Pagnier I. , Raoult D. , Colson P. La familia en expansión Marseilleviridae.  (Inglés)  // Virología. - 2014. - Octubre ( vol. 466-467 ). - P. 27-37 . -doi : 10.1016/ j.virol.2014.07.014 . — PMID 25104553 .
  10. Levasseur A. , Bekliz M. , Chabrière E. , Pontarotti P. , La Scola B. , Raoult D.  MIMIVIRE es un sistema de defensa en mimivirus que confiere resistencia al virófago  // Naturaleza. - 2016. - Vol. 531, núm. 7593. - Pág. 249-252. -doi : 10.1038/ naturaleza17146 . — PMID 26934229 .
  11. Claverie J. M., Abergel C.  Sistema similar a CRISPR-Cas en virus gigantes: por qué no es probable que MIMIVIRE sea un sistema inmunitario adaptativo  // Virologica Sinica. - 2016. - Vol. 31, núm. 3.- Pág. 193-196. -doi : 10.1007 / s12250-016-3801-x . — PMID 27315813 .