Zamilón | ||||||||
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clasificación cientifica | ||||||||
Grupo:virus [1]Reino:varidnaviriaReino:BamfordviraeTipo de:PreplasmiviricotaClase:MaveriviricetesOrdenar:priklausoviralesFamilia:virófagosGénero:SputnikvirusVista:Zamilón | ||||||||
nombre científico internacional | ||||||||
Virus Zamilon dependiente de mimivirus | ||||||||
Sinónimos | ||||||||
según NCBI [2] :
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el grupo de baltimore | ||||||||
I: virus dsDNA | ||||||||
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Zamilon [3] ( Ing. Mimivirus-dependiente de virus Zamilon , anteriormente Zamilon virophage ) es un virófago que infecta a la ameba Acanthamoeba polyphaga . Fue aislado en 2013 en Túnez a partir de una muestra de suelo junto con el virus Mont1 . La palabra "zamilon" en la traducción de Ar. - "vecino". El Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) identifica este virus como una especie separada del género Sputnikvirus de la familia Lavidaviridae [4] . En 2015, se describió en América del Norte un virófago estrechamente relacionado con Zamilon y se denominó "Zamilon 2" [5] .
Zamilon es una partícula esférica con un diámetro de 50-60 nm y se parece a otros virófagos, a saber, Sputnik y mavirus . El genoma de Zamilon es una molécula de ADN circular de 17 276 pares de bases (pb) con un bajo contenido de GC (29,7 %), que contiene 20 marcos de lectura abiertos (ORF) que varían en longitud de 222 a 2337 pb. El genoma de Zamilon es significativamente diferente del genoma de Sputnik: tienen un 76 % de nucleótidos idénticos mientras que cubren el genoma de Sputnik en un 75 %. Sin embargo, 17 ORF de Zamilon son homólogos a los genes Sputnik , dos ORF son homólogos a los genes de Megavirus chiliensis y un ORF es homólogo a Moumouvirus monve [6] . Entre las proteínas predichas de Zamilon, fue posible identificar transposasa , helicasa , integrasa , cisteína proteasa , ADN primasa polimerasa , así como ATPasas que empaquetan el ADN en viriones , proteínas de la cápside mayor y pequeña , proteína estructural y proteína similar al colágeno . . El sexto producto ORF es muy similar a la proteína principal de la cápside Sputnik, que contiene el motivo estructural característico " plegado en rollo de gelatina " [7] [8] .
Al igual que otros virófagos, la replicación del genoma de Zamilon se produce en el citoplasma de la célula huésped , más precisamente, en la fábrica viral del virus huésped. Inicialmente, Zamilon se aisló junto con la cepa Mont1, que forma parte de la familia Mimiviridae . Posteriormente, se demostró que cepas de Moumouvirus, Monve, Terra1 y Courdo11, también incluidas en la familia Mimiviridae , pueden actuar como virus hospedadores para Zamilon , pero no mamivirus y mimivirus [9] . En este sentido, Zamilon difiere de Sputnik, cuyo virus huésped puede ser cualquier miembro de la familia Mimiviridae [7] .
Aparentemente, Zamilon no tiene un fuerte efecto inhibitorio sobre la multiplicación del virus huésped y su capacidad para provocar la lisis de las células de ameba del huésped. Aunque el virus huésped tiene una alta proporción de viriones defectuosos en presencia de Zamilon, esto se observa a menudo en ausencia del virófago. Esto también distingue a Zamilon de Sputnik, que reduce la infectividad del virus huésped y suprime la lisis de las células infectadas [7] .
En 2016 apareció un informe sobre el descubrimiento en mimivirus del grupo A de un mecanismo responsable de la resistencia al virófago Zamilon. El elemento clave de este mecanismo es el sistema genético MIMIvirus VIrophage Resistant Element (MIMIVIRE) que contiene varios insertos correspondientes a secuencias del genoma de Zamilon. Se ha sugerido que el sistema basado en MIMIVIRE funciona de manera similar a los sistemas CRISPR /Cas que brindan protección contra virus en bacterias y arqueas : los ARN se sintetizan a partir de insertos en el genoma de Mimivirus , que se unen de manera complementaria a los genomas de virófagos, lo que lleva a su destrucción. [10] . Esta conclusión está respaldada por datos de experimentos para desactivar MIMIVIRE. Sin embargo, esta hipótesis tiene una serie de problemas. No está claro, por ejemplo, cómo el sistema MIMIVIRE distingue insertos del genoma del virófago en el genoma del mimivirus de las mismas secuencias en el genoma del virófago y evita la destrucción del genoma del propio mimivirus. Se ha propuesto un mecanismo alternativo de funcionamiento de MIMIVIRE, que no se basa en interacciones complementarias de ácidos nucleicos , sino en interacciones proteína-proteína [11] .
Taxonomía |
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