Potenciador
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Enhancer ( inglés Enhancer - amplificador, ampliador) es una pequeña porción de ADN que, después de unirle factores de transcripción , estimula la transcripción de los principales promotores de un gen o grupo de genes. Los potenciadores no están necesariamente ubicados muy cerca de los genes cuya actividad regulan, y ni siquiera están necesariamente ubicados en el mismo cromosoma que ellos. Los potenciadores se pueden ubicar tanto en la posición 5' como en la 3' con respecto a la cadena molde del gen regulado y en cualquier orientación con respecto a ella. Los potenciadores también se pueden encontrar dentro de los intrones.. Sin embargo, para que el potenciador funcione, necesita contacto físico con el promotor, que se lleva a cabo debido al bucle de ADN entre el potenciador y el promotor [1] . El mecanismo de acción molecular del potenciador es que, debido al complejo proteico ensamblado sobre él, atrae la ARN polimerasa II y los cofactores de transcripción hacia la región promotora.
Los potenciadores se descubrieron por primera vez en sistemas eucariotas [2] [3] , pero posteriormente se descubrieron ejemplos similares de regulación transcripcional en procariotas [4] .
Propiedades del potenciador
Las regiones potenciadoras de la cromatina tienen las siguientes propiedades [5] :
Sobre la base de estas propiedades, se han encontrado alrededor de un millón de potenciadores potenciales en el genoma humano utilizando métodos de alto rendimiento [6] [7] .
Teorías
Por el momento, existen dos teorías que explican el mecanismo de lectura de la información del potenciador:
Notas
- ↑ Lee T.I. , Regulación transcripcional de Young RA y su mala regulación en la enfermedad. (Inglés) // Celular. - 2013. - Vol. 152, núm. 6 _ - Pág. 1237-1251. -doi : 10.1016 / j.cell.2013.02.014 . — PMID 23498934 .
- ↑ Banerji J. , Rusconi S. , Schaffner W. La expresión de un gen de beta-globina se ve reforzada por secuencias remotas de ADN de SV40. (Inglés) // Celular. - 1981. - vol. 27, núm. 2 punto 1 . - Pág. 299-308. —PMID 6277502 .
- ↑ Moreau P. , Hen R. , Wasylyk B. , Everett R. , Gaub MP , Chambon P. La repetición de reparación de base SV40 72 tiene un efecto sorprendente en la expresión génica tanto en SV40 como en otros recombinantes quiméricos. (Inglés) // Investigación de ácidos nucleicos. - 1981. - vol. 9, núm. 22 . - Pág. 6047-6068. —PMID 6273820 .
- ↑ Xu H. , Hoover TR Regulación transcripcional a distancia en bacterias. (Inglés) // Opinión actual en microbiología. - 2001. - vol. 4, núm. 2 . - Pág. 138-144. — PMID 11282468 .
- ↑ Li W. , Notani D. , Rosenfeld MG Enhancers como unidades de transcripción de ARN no codificante: conocimientos recientes y perspectivas futuras. (Inglés) // Reseñas de la naturaleza. genética. - 2016. - Vol. 17, núm. 4 . - Pág. 207-223. -doi : 10.1038/ nrg.2016.4 . — PMID 26948815 .
- ↑ Una enciclopedia integrada de elementos de ADN en el genoma humano. (Inglés) // Naturaleza. - 2012. - vol. 489, núm. 7414 . - Pág. 57-74. -doi : 10.1038/ naturaleza11247 . —PMID 22955616 .
- ↑ Thurman RE , Rynes E. , Humbert R. , Vierstra J. , Maurano MT , Haugen E. , Sheffield NC , Stergachis AB , Wang H. , Vernot B. , Garg K. , John S. , Sandstrom R. , Bates D. , Boatman L. , Canfield TK , Diegel M. , Dunn D. , Ebersol AK , Frum T. , Giste E. , Johnson AK , Johnson EM , Kutyavin T. , Lajoie B. , Lee BK , Lee K. , London D. , Lotakis D. , Neph S. , Neri F. , Nguyen ED , Qu H. , Reynolds AP , Roach V. , Safi A. , Sanchez ME , Sanyal A. , Shafer A. , Simon JM , Song L . , Vong S. , Weaver M. , Yan Y. , Zhang Z. , Zhang Z. , Lenhard B. , Tewari M. , Dorschner MO , Hansen RS , Navas PA , Stamatoyannopoulos G. , Iyer VR , Lieb JD , Sunyaev SR , Akey JM , Sabo PJ , Kaul R. , Furey TS , Dekker J. , Crawford GE , Stamatoyannopoulos JA El paisaje de cromatina accesible del genoma humano. (Inglés) // Naturaleza. - 2012. - vol. 489, núm. 7414 . - Pág. 75-82. -doi : 10.1038/ naturaleza11232 . —PMID 22955617 .
Véase también
- STARR-seq es un método de alto rendimiento para identificar potenciadores en genomas.
Literatura
- Wenbo Li, Dimple Notani y Michael G. Rosenfeld (2016). Potenciadores como unidades de transcripción de ARN no codificantes: conocimientos recientes y perspectivas futuras . Nature Review Genetics doi : 10.1038/nrg.2016.4
- Andersson, R. y otros (2014). Un atlas de potenciadores activos en tipos de células y tejidos humanos. Naturaleza 507, 455–461 doi : 10.1038/ naturaleza12787 PMID 24670763
- Cheng, JH, Pan, DZ, Tsai, ZT y Tsai, HK (2015). Análisis de todo el genoma del ARN potenciador en la regulación génica en 12 tejidos de ratón. ciencia Reps. 5, 12648 doi : 10.1038/srep12648 PMC 4518263
Enlaces
- HACNS1: potenciador de genes en la evolución del pulgar oponible humano
- Spilianakis CG, Lalioti MD, Town T., Lee GR, Flavell RA Asociaciones intercromosómicas entre loci expresados alternativamente (inglés) // Nature: journal. - 2005. - vol. 435 , núm. 7042 . - Pág. 637-645 . -doi : 10.1038/ naturaleza03574 .
- Arnosti DN, Kulkarni MM Potenciadores transcripcionales: ¿mejoradores inteligentes o carteleras flexibles? (Inglés) // J. Cell. Bioquímica : diario. - 2005. - vol. 94 , núm. 5 . - Pág. 890-898 . -doi : 10.1002/ jcb.20352 . Archivado desde el original el 21 de julio de 2006.
- Leighton Core, André Martins, Charles Danko, Colin Waters, Adam Siepel y John Lis. El análisis de los sitios de inicio de la transcripción del ARN naciente identifica una arquitectura unificada de regiones de iniciación en promotores y potenciadores de mamíferos . Nature Genetics, noviembre de 2014 doi : 10.1038/ng.3142