La terminación interna , también terminación independiente de ρ, terminación independiente de Rho , es un mecanismo para detener la transcripción de genes en procariotas [1] . La esencia de este mecanismo es la siguiente: el ARNm contiene una secuencia enriquecida con guanina-citosina, que puede formar estructuras tipo horquilla de 7 a 20 pares de bases de longitud. La guanina y la citosina forman tres enlaces de hidrógeno entre sí y, por lo tanto, están bastante unidas [2] . Inmediatamente después de la horquilla, hay una zona enriquecida con uracilo . Los enlaces entre el uracilo y la adenina son muy débiles. La proteína asociada a la ARN polimerasa ( nusA ) se une con tanta fuerza a la horquilla que hace que la polimerasa se apague temporalmente y la transcripción cese [3] . En este punto, la polimerasa se ubica en la región de poliuracilo de la secuencia. Los enlaces débiles de adenina-uracilo reducen la energía de desestabilización del dúplex ARN-ADN, lo que les permite debilitar la tensión de la cadena de polinucleótidos y disociar de la ARN polimerasa [2] .
Los elementos Rho que no contienen una secuencia de poliuracilo pueden detener la ARN polimerasa, pero generalmente continúa la transcripción después de un tiempo, porque el dúplex es demasiado estable para causar la disociación de la ARN polimerasa y la posterior terminación.
La terminación transcripcional independiente de Rho es un mecanismo común que subyace a la actividad de los elementos de ARN reguladores en cis , como los ribointerruptores .
| Transcripción (biología) | |||||||||||||
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| Reglamento de transcripción |
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| Activación | |||||||||||||
| Iniciación | Sitio de inicio de la transcripción | ||||||||||||
| Alargamiento |
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| Terminación | |||||||||||||