La cepa alfa del SARS-CoV-2 [1] , también conocida como VOC-202012/01, línea B.1.1.7 o 20B/501Y.V1, es una cepa del virus SARS-CoV-2 que causa la COVID-19 . Esta cepa se detectó por primera vez a principios de diciembre de 2020 durante la pandemia de COVID-19 en el Reino Unido . Las primeras muestras con la cepa detectada se tomaron el 20 de septiembre [2] . A mediados de diciembre, la tensión comenzó a extenderse rápidamente. Esto se correlaciona con un aumento significativo en la incidencia de infecciones por COVID-19 en el Reino Unido; Se cree que este aumento se debe, al menos en parte, a la mutación N501Y dentro del dominio de unión al receptor de la glicoproteína espiga, que se une al receptor ACE2 en las células humanas. La cepa también se destaca por una gran cantidad de mutaciones en comparación con la tendencia de mutación del SARS-CoV-2 conocida en diciembre de 2020 [3] .
En Rusia, el primer caso de infección por ella se detectó a fines de 2020 [4] .
La cepa es conocida por varios nombres. Se le conoce comúnmente como la "cepa británica de COVID-19" y la "cepa británica de coronavirus" en informes gubernamentales y medios de comunicación. Esta cepa se denominó anteriormente "la primera cepa en revisión en diciembre de 2020". (VUI - 202012/01) por Public Health England, pero fue actualizado a Strain of Concern (Variant of Concern 202012/01) por Mira Chand y sus colegas en un informe publicado por Public Health England el 21 de diciembre de 2020. En un informe escrito en nombre del Consorcio de Genómica COVID-19 del Reino Unido (COG-UK), Andrew Rumbaugh y los coautores se refirieron a esta cepa como linaje B.1.1.7. El CDC también se refiere a esta cepa como 20B/501Y.V1.
Las mutaciones en el virus SARS-CoV-2 son bastante comunes: según el Consorcio de Genómica COVID-19 del Reino Unido (COG-UK), se han encontrado más de 4.000 mutaciones solo en la glicoproteína espiga en diferentes cepas de este virus.
La cepa VOC-202012/01 se define por 23 mutaciones: 13 mutaciones no sinónimas, 4 deleciones y 6 mutaciones sinónimas (es decir, 17 mutaciones cambian proteínas y seis no).
El 2 de febrero de 2021, funcionarios británicos informaron que entre 214 000 muestras secuenciadas genéticamente de esta cepa, 11 también tenían la mutación E484K [5] [6] .
El organismo asesor científico británico NERVTAG (Grupo Asesor sobre Virus Respiratorios Nuevos y Emergentes) concluyó el 18 de diciembre de 2020 que tiene una confianza moderada en que VUI-202012/01 es significativamente más transmisible que otras cepas, y los datos aún no son suficientes para sacar conclusiones definitivas. sobre el mecanismo subyacente del aumento de la transmisibilidad (p. ej., aumento de la carga viral, distribución tisular de la replicación viral, intervalos de serie, etc.), distribución de casos por edad o gravedad de la enfermedad. Los datos obtenidos por NERVTAG mostraron que esta cepa tiene un "factor de selección" de 0,70 (70%), lo que sugiere un intervalo generacional de 6,5 días. En trabajos más recientes se ha utilizado como medida el número relativo de reproducciones, que es un indicador del coeficiente de selección. Según datos ligeramente diferentes, se determinó que el número relativo de reproducciones ("ventaja multiplicadora") era 1,74 (lo que significa que esta cepa es un 74 % más transmisible). Esta variedad se volvió dominante en Londres y el este y sureste de Inglaterra en uno o dos meses. Se ha observado un rápido crecimiento similar en Irlanda, y parece que esta variedad pronto se volverá dominante allí también. Se espera que Estados Unidos haga lo mismo en marzo. El aumento de las infecciones por SARS-CoV-2 a principios del nuevo año se debe a la mayor transmisibilidad de esta cepa, mientras que la incidencia de otras cepas está disminuyendo. Esto exige restricciones más estrictas para evitar un rápido aumento exponencial de las infecciones. El control de transmisión de esta cepa, a su vez, se ve cada vez más débil.
Uno de los cambios más importantes en VOC-202012/01 parece ser N501Y, el reemplazo de asparagina (N) con tirosina (Y) en el sitio de aminoácido 501. Esto se debe a su posición dentro del dominio de unión al receptor de la espiga. glicoproteína (RBD): más específicamente, dentro del motivo de unión al receptor (RBM), la parte del RBD que se une al receptor ACE2 humano. Las mutaciones en RBD pueden alterar el reconocimiento de anticuerpos y la especificidad de unión de ACE2 y hacer que el virus se vuelva más infeccioso. De hecho, Chand et al., concluyeron que “es muy probable que la mutación N501Y afecte la afinidad de unión de la proteína espiga al receptor, y es posible que esta mutación sola o en combinación con una deleción 69/70 en la proteína N- dominio terminal (NTD) mejora la transmisibilidad del virus.
Los estudios preliminares sugieren un aumento de la transmisibilidad del 30-70%, además, permiten un aumento de la mortalidad [7] .
A fines de 2020, se estaban introduciendo o desarrollando varias vacunas contra el COVID-19 .
Sin embargo, a medida que ocurren más mutaciones, es posible que sea necesario modificar la vacuna. El SARS-CoV-2 no muta tan rápido como los virus de la influenza, por ejemplo, y las nuevas vacunas que han demostrado ser efectivas a fines de 2020 son tipos que se pueden cambiar si es necesario. A finales de 2020, las autoridades sanitarias y los expertos de Alemania, el Reino Unido y Estados Unidos creen que las vacunas existentes serán tan eficaces contra la cepa VOC-202012/01 como contra las cepas anteriores.
El 18 de diciembre de 2020, NERVTAG concluyó que "actualmente no hay evidencia suficiente para sacar ninguna conclusión [...] sobre la insensibilidad de esta cepa a los antígenos de la vacuna".
Al 20 de diciembre de 2020, el Servicio de Salud Pública del Reino Unido confirmó que "no hay evidencia" de que la nueva cepa sea resistente a la vacuna Pfizer-BioNTech que se usa actualmente en el programa de vacunación del Reino Unido, por lo que las personas vacunadas aún están protegidas.