Código KF

El código CF (“clasificación de enzimas”), o código de enzima,  es el número de clasificación de la enzima según la clasificación jerárquica internacional. El sistema adoptado clasifica las enzimas en grupos e indexa enzimas individuales, lo cual es importante para la estandarización de la investigación.

La clasificación de las enzimas se basa y se actualiza periódicamente por la Comisión de enzimas ( ing.  Comisión de enzimas , de ahí el término "número EC", adoptado en la literatura inglesa) en la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular . Cada código CF también está asociado con el nombre recomendado de la enzima correspondiente. Se han clasificado más de 3500 enzimas.

Principio de clasificación

La clasificación de las enzimas tiene en cuenta la reacción y la especificidad de sustrato de las enzimas, y no su estructura proteica . El código CF define la reacción química catalizada por la enzima. Por esta razón, enzimas similares (a veces docenas) de diferentes organismos tienen el mismo CF, a pesar de las diferencias estructurales.

A veces, diferentes enzimas del mismo organismo tienen el mismo CF. Por ejemplo, la lipasa pancreática y la lipasa hepática pertenecen ambas a EC 3.1.1.3 , ya que catalizan la misma reacción química ( hidrólisis de un enlace éster en los triglicéridos ), aunque la primera enzima es digestiva y actúa en el intestino , y la segunda se refiere a las enzimas del metabolismo de las lipoproteínas en la sangre .

Existe una base de datos UniProt [1] que identifica cada proteína por su secuencia primaria. Ambas bases de datos se complementan.

Formato de cifrado

Cada número de clasificación contiene la abreviatura KF y una secuencia de cuatro números separados por puntos, y se compila de acuerdo con un principio determinado. Cada número sucesivo representa una clasificación cada vez más precisa de la enzima. Dado que la base de datos se actualiza constantemente, los códigos pueden cambiar y los códigos de algunos niveles pueden permanecer en blanco.

Clase

Subclase

Sub-subclase

Código de nivel 4

Finalmente, todas las enzimas que pertenecen a esta sub-subclase reciben su número de serie ( el cuarto número en el código).

CF 1 - Oxidorreductasas EC 1.1 - Alcohol oxidorreductasa EC 1.1.3 - Oxidorreductasas que oxidan el grupo CH-OH y reducen el oxígeno . EC 1.1.3.4 - Oxidorreductasas que oxidan la glucosa en presencia de oxígeno . Se conocen un total de 3 glucosa oxidasas de diferentes organismos.

Códigos de primer nivel

Clase reacción catalizada tipo de reacción Ejemplos
CF 1
Oxidorreductasa
Reacciones redox. Transferencia de átomos de H y O o electrones de un sustrato a otro AH + B → A + BH ( reducción )
A + O → AO ( oxidación )
deshidrogenasa , oxidasa
CF 2
transferasas
Transferencia de un grupo funcional de un sustrato a otro. Puede ser un grupo metilo, acilo, fosfato o amino. AB+C→A+BC aminotransferasa , quinasas
KF 3
hidrolasas
Formación de dos productos a partir de un sustrato por hidrólisis . AB + H2O → AOH + BH lipasa , amilasa , proteasa , fosfatasa
KF 4
Liasas (sintasas)
La adición o eliminación no hidrolítica de un grupo hacia o desde un sustrato. Formación de enlaces CC, CN, CO o CS. RCOCOOH → RCOH + CO2 carboxilasa
KF 5
Isomerasas
Reordenamiento intramolecular, es decir, isomerización de la molécula de sustrato. AB→BA isomerasas , mutasas , etc.
CF 6
ligasas (sintetasas)
La conexión de dos moléculas como resultado de la síntesis de un nuevo enlace CO, CS, CN o CC , junto con la hidrólisis simultánea de ATP . X + Y + ATP → XY + ADP + Pi sintetasa
KF 7

Translocasas

El transporte de iones o moléculas a través de membranas o su separación en membranas. proteínas de transporte de membrana [2]

Historia

El esquema de nomenclatura de enzimas se desarrolló por primera vez en 1955 cuando el Congreso Internacional de Bioquímica en Bruselas estableció la Comisión de Enzimas . La primera versión de la nomenclatura apareció en 1961 e incluía alrededor de 900 enzimas, en la versión de 1978 había más de 2000 enzimas. La versión de 1995 contiene más de 3500 enzimas.

Véase también

Notas

  1. ENZYME (base de datos de nomenclatura de enzimas) (enlace no disponible) . ExPASy. Consultado el 14 de marzo de 2006. Archivado desde el original el 18 de febrero de 2006. 
  2. Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular. Una nueva clase de enzimas: translocasas. . NOTICIAS IUBMB (agosto 2018).

Enlaces