El ARN de interferencia pequeño asociado a repeticiones , rasiRNA ( en inglés , Repeat Associated Small Interfering RNA, rasiRNA ) es un grupo de ARN pequeños no codificantes que actúan mediante el mecanismo de interferencia de ARN . A menudo, muchos rasiRNA se clasifican como piRNA , una clase de pequeños ARN no codificantes que interactúan con las proteínas Piwi , Aub y Ago3 de la familia Argonaute [1] . En las células de la línea germinal, los rasiRNA están involucrados en la formación y el mantenimiento de la heterocromatina , el control de las transcripciones leídas de secuencias repetitivas . , y silenciamiento de transposones y retrotransposones [2] [3] .
RasiRNAs fueron descubiertos en 2001 en la mosca de la fruta Drosophila melanogaster [4] .
Se han encontrado rasiRNA en la mosca de la fruta Drosophila y algunos eucariotas unicelulares , pero no se han confirmado en mamíferos , a diferencia de los piRNA que se encuentran en muchas especies de invertebrados y vertebrados , incluidos los mamíferos [5] . Sin embargo, dado que las proteínas de unión a rasiRNA se encuentran en invertebrados y vertebrados, también pueden tener rasiRNA que aún no se han descubierto. Los RasiRNA están presentes en la levadura Schizosaccharomyces pombe , así como en algunas plantas , y no se ha encontrado que ninguna de estas especies contenga proteínas Piwi (Piwi se encuentra solo en animales [6] ) [7] . Se ha demostrado que tanto el piRNA como el rasiRNA se heredan por vía materna ; sin embargo, lo más probable es que las proteínas Piwi se hereden por vía materna, por lo que se observó la herencia materna tanto del piRNA como del rasiRNA [8] .
Los rasiRNA son distintos de otras clases de RNA que realizan interferencia de RNA: miRNA , RNA de interferencia pequeños (siRNA) y piRNA. A diferencia de los microRNA y siRNA que interactúan con el grupo AGO de la familia Argonaute, los rasiRNA interactúan con el grupo Piwi de proteínas de la misma familia [9] [10] . Los RasiRNA también difieren en su tamaño. A diferencia de los microRNA de 21 a 23 nucleótidos (n) de largo, los siRNA tienen de 20 a 25 nt de largo. y piRNA de 24-31 pb de largo. rasiRNA tiene una longitud de 24 a 29 pb. dependiendo del organismo [11] . Mientras que los siRNA se forman a partir de transcritos con sentido y antisentido , los rasiRNA se forman exclusivamente a partir de antisentido [12] . Además, aunque el procesamiento de microRNA requiere Dicer -1 y siRNA Dicer -2, rasiRNA no requiere ninguna de estas proteínas. Sin embargo, las plantas tienen proteínas similares a Dicer (Dcl), con Dcl1 procesando miRNA y siRNA de 24 nt de largo, y Dcl2 procesando rasiRNA de 24 nt de largo [7] [13] . Estos datos indican que la producción de rasiRNA no solo difiere de la de miRNA y siRNA, sino que también funciona rasiRNA en plantas en ausencia de proteínas Piwi [7] .
Se supone que los ARN de doble cadena son la fuente de los rasiARN , que se forman durante la hibridación de transcritos sentido y antisentido de elementos genéticos móviles . La biogénesis de rasiRNA es independiente de Dicer, pero requiere proteínas de la familia Argonaute: Ago3, Piwi y la proteína tipo Piwi Berenjena (Aub). La vía rasiRNA es un ciclo de ping-pong. En primer lugar, una molécula de rasiRNA ya existente en complejo con proteínas Piwi/Aub se une al transcrito primario de un elemento transponible o secuencias repetitivas (de ahí el nombre de este grupo de ARN [2] ) y hace que el fragmento del transcrito se trunque. Uno de los fragmentos restantes se une a la proteína Ago3 y, junto con ella, se une al transcrito primario antisentido, lo que cataliza el corte del fragmento. Este fragmento luego se une a Piwi/Aub y puede degradar aún más las transcripciones maliciosas y generar simultáneamente nuevos rasiRNA (ciclo ping-pong). El esquema de la izquierda muestra el esquema de este proceso que indica el procesamiento del extremo 5' de rasiRNA; sin embargo, la ruta de procesamiento del extremo 3' sigue siendo desconocida [7] .
Mientras que el microARN lleva a cabo la represión a nivel de traducción y destrucción del ARNm , el siARN destruye el ARNm, el rasiARN está involucrado en la regulación de la estructura de la cromatina y el silenciamiento de la traducción [7] . En Drosophila , las mutaciones en las proteínas Piwi de unión a rasiRNA dan como resultado la esterilidad y la pérdida de células de la línea germinal tanto en machos como en hembras [11] . La represión de los transposones no depende de la pérdida de Dicer por parte de las células de la línea germinal; por lo tanto, son el objetivo de la acción de rasiRNA (el procesamiento de microRNA y siRNA depende de Dicer) [7] . Al igual que los miARN y los siARN, la vía del rasiARN está conservada evolutivamente . En ausencia de la vía rasiRNA, la retransposición puede ocurrir en las células de la línea germinal, lo que provoca daños en el ADN y desencadena la apoptosis [14] .
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